RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384443.1

RNU6-1162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1162P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ARFIP1P53367 373 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 CCL23P55773 120 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 MAZP56270 477 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 EVA1CP58658 441 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 RPS18P62269 152 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 PRR3P79522 188 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 AMPD3Q01432 767 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 SYCNQ0VAF6 134 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 VGLL4Q14135 290 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 GNMTQ14749 295 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 CASP8Q14790 479 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 PPP2R5BQ15173 497 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 TAB1Q15750 504 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ZNF77Q15935 545 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 STX1AQ16623 288 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 MEA1Q16626 185 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 UGCGQ16739 394 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ZBED5Q49AG3 693 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 SYT14P1Q58G82 188 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ODF2Q5BJF6 829 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 TAF7LQ5H9L4 462 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 C6orf136Q5SQH8 315 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 LIN9Q5TKA1 542 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 LCN1P1Q5VSP4 162 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 C22orf42Q6IC83 251 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 OR4C11Q6IEV9 310 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 FRMPD2BQ6IN97 320 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 MOXD1Q6UVY6 613 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 CD300LGQ6UXG3 332 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 C2orf66Q6UXQ4 117 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 CASP12Q6UXS9 341 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 RNF165Q6ZSG1 346 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ZNF621Q6ZSS3 439 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 CHST3Q7LGC8 479 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 FAM220AQ7Z4H9 259 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 LYG2Q86SG7 212 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 CPOQ8IVL8 374 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 MFSD6LQ8IWD5 586 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 UBALD2Q8IYN6 164 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 CLECL1Q8IZS7 167 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 TAGAPQ8N103 731 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 DYNAPQ8N1N2 210 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 GPR137CQ8N3F9 429 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 C10orf126Q8N4M7 172 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 GCSAMQ8N6F7 178 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 TEX19Q8NA77 164 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 SLC37A3Q8NCC5 494 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 C11orf65Q8NCR3 313 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 FAM156AQ8NDB6 213 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 BBS1Q8NFJ9 593 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 OR2T33Q8NG76 320 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 OR11H4Q8NGC9 324 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 OR52I1Q8NGK6 324 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 OR13G1Q8NGZ3 307 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 C8orf46Q8TAG6 207 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 FANK1Q8TC84 345 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ANKRD49Q8WVL7 239 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 OR5P3Q8WZ94 311 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 RUBCNQ92622 972 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 TM4SF19Q96DZ7 209 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 SGK494Q96LW2 274 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 LRGUKQ96M69 825 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 MBOAT7Q96N66 472 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ANKRD27Q96NW4 1050 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 NEK1Q96PY6 1258 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 TSPAN32Q96QS1 320 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 OR2M2Q96R28 347 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 MAP7D2Q96T17 732 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 TBCBQ99426 244 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ZBTB18Q99592 522 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 GPR22Q99680 433 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 NPAS2Q99743 824 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 HSD17B14Q9BPX1 270 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 SLC26A6Q9BXS9 759 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1162P-201ENST00000384443 ATG10Q9H0Y0 220 aa-0.59□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms