RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 HIVEP1P15822 2718 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 OR14I1A6ND48 311 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 UBXN8O00124 270 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 FAM155BO75949 473 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 TGFB1P01137 390 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 GSTA2P09210 222 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 CNR1P21554 472 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ABCD3P28288 659 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 SERPINB1P30740 379 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 SSR2P43308 183 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 MAGEA5P43359 124 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 DNASE1L1P49184 302 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 NUP107P57740 925 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 PLGLB1Q02325 96 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 GRTP1Q5TC63 336 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 PAOXQ6QHF9 649 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 OPN5Q6U736 354 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 TRILQ7L0X0 811 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 RNF175Q8N4F7 328 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ELOA3Q8NG57 546 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 NUBPLQ8TB37 319 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 RAB24Q969Q5 203 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 UBE2E3Q969T4 207 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 FBXL20Q96IG2 436 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 C16orf92Q96LL3 132 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 SMC6Q96SB8 1091 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 UCK2Q9BZX2 261 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 OR51B5Q9H339 312 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 VGLL3A8MV65 326 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 PTGES3LE9PB15 166 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 HRKO00198 91 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 PLPP1O14494 284 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 BCKDKO14874 412 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 SH3BGRLO75368 114 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 SCGB1D1O95968 90 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ITGA5P08648 1049 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 PCNAP12004 261 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 TNNI3P19429 210 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 CPN2P22792 545 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ACVR2AP27037 513 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 TNFRSF17Q02223 184 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 FOLH1Q04609 750 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 C2orf54Q08AI8 447 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 PMPCAQ10713 525 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 ASPHQ12797 758 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 GXYLT1Q4G148 440 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 PIGGQ5H8A4 983 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 C18orf63Q68DL7 685 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-201ENST00000379445 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms