RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PRRC1Q96M27 445 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 TGM7Q96PF1 710 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PCED1AQ9H1Q7 454 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 A0A1W2PPC1 479 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 GABRB1P18505 474 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 NR4A1P22736 598 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 SMIM11AP58511 58 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 NKAIN2Q5VXU1 208 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 DNAJC22Q8N4W6 341 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 OR52P1PQ8NH57 321 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 TANKQ92844 425 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 MAT2BQ9NZL9 334 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 KLHL3Q9UH77 587 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 SLC13A4Q9UKG4 626 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 MGAT4BQ9UQ53 548 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ZAR1LA6NP61 321 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 LMO7DNF2Z398 122 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CNR2P34972 360 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 RAB38P57729 211 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PRTGQ2VWP7 1150 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 FUNDC2Q9BWH2 189 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 WDR45Q9Y484 360 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 LILRA5A6NI73 299 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 NTN1O95631 604 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 UGT2B15P54855 530 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 DEPDC4Q8N2C3 294 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 OR4K5Q8NGD3 323 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PIK3R3Q92569 461 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 RORBQ92753 470 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 SELENONQ9NZV5 590 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ENOPH1Q9UHY7 261 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 NOL3O60936 208 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ALDH4A1P30038 563 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 MVKQ03426 396 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 DMWDQ09019 674 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 TCTN2Q96GX1 697 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 SPACA7Q96KW9 195 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 COPS4Q9BT78 406 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 OR2W5A6NFC9 320 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 H3BN98 237 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 SYT5O00445 386 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PLOD3O60568 738 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 OSMP13725 252 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 TMBIM6P55061 237 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 MGAT2Q10469 447 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PRSS48Q7RTY5 328 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ARHGDIGQ99819 225 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CAPN10Q9HC96 672 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 SOHLH2Q9NX45 425 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 NTNG1Q9Y2I2 539 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 FOXS1O43638 330 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 TAS2R41P59536 307 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CDC42P60953 191 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 GPR68Q15743 365 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 SYT16Q17RD7 645 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 INAVAQ3KP66 663 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ZER1Q7Z7L7 766 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PEX11GQ96HA9 241 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 SIGLEC11Q96RL6 698 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 SDF2Q99470 211 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 FBXO34Q9NWN3 711 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 GPR83Q9NYM4 423 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 TMEM9Q9P0T7 183 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 AGR2O95994 175 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 MMP11P24347 488 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 PRKAR1BP31321 381 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ZP2Q05996 745 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX3-201ENST00000371746 ERV3-1Q14264 604 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms