RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358506.6

PPP1CB-202, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PPP1CB, Length 4,771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-202ENST00000358506 REEP5Q00765 189 aa15.64■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 ZNF45Q02386 682 aa15.64■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PIGKQ92643 395 aa15.64■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 CDS1Q92903 461 aa15.64■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.64■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 A0A075B6Q4 140 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 ZNF879B4DU55 563 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 NPIPA7E9PJI5 369 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PPM1BO75688 479 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 KLHL18O94889 574 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 HEXBP07686 556 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 NPIPA8P0DM63 369 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 AP3S2P59780 193 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 B4GALNT1Q00973 533 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 TCTE1Q5JU00 501 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 METRNLQ641Q3 311 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 VWA5B2Q8N398 1253 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 C1orf216Q8TAB5 229 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 ALG14Q96F25 216 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 DMRTB1Q96MA1 342 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 FKBP7Q9Y680 259 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 H3BSH0 61 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 GFRA2O00451 464 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SLITRK5O94991 958 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 LRIF1Q5T3J3 769 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 C1orf189Q5VU69 101 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 KLBQ86Z14 1044 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SAMD8Q96LT4 415 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 OR7D2Q96RA2 312 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 NEU3Q9UQ49 428 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PYCR1P32322 319 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 CXCR4P61073 352 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 CSNK1G2P78368 415 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PLCXD2Q0VAA5 305 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PLBD1Q6P4A8 553 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SPATC1Q76KD6 591 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PPP1R14BQ96C90 147 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 C19orf43Q9BQ61 176 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 METTL7AQ9H8H3 244 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PLEKHA1Q9HB21 404 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 C11orf98E9PRG8 122 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 MAP3K8P41279 467 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 CBLBQ13191 982 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 ODF4Q2M2E3 257 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 GFOD2Q3B7J2 385 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 CCNJQ5T5M9 372 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 FAM71E1Q6IPT2 247 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 TBPL2Q6SJ96 375 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 OR4K17Q8NGC6 315 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PRRC1Q96M27 445 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 COQ10AQ96MF6 247 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PDCD10Q9BUL8 212 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 POLE4Q9NR33 117 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 TAAR2Q9P1P5 351 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC7A7Q9UM01 511 aa15.63■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 ECDO95905 644 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 CTHP32929 405 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 DPTQ07507 201 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PODNL1Q6PEZ8 512 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 HDDC2Q7Z4H3 204 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PLXDC1Q8IUK5 500 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC15A4Q8N697 577 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 MFSD9Q8NBP5 474 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 ZNF559Q9BR84 538 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 COMMD9Q9P000 198 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC5A2P31639 672 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PITPNAQ00169 270 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 DEFB133Q30KQ1 61 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC44A3Q8N4M1 653 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 TMEM156Q8N614 296 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 ANKK1Q8NFD2 765 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 TANKQ92844 425 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 DPH1Q9BZG8 443 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SESN1Q9Y6P5 492 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 GXYLT2A0PJZ3 443 aa15.62■□□□□ 0.09
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC22A31A6NKX4 558 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms