RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335046.7

UBE2C-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UBE2C, Length 737 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-202ENST00000335046 NPSR1Q6W5P4 371 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2C-202ENST00000335046 MIER2Q8N344 545 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2C-202ENST00000335046 OR2M7Q8NG81 312 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2C-202ENST00000335046 OR10G3Q8NGC4 313 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2C-202ENST00000335046 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2C-202ENST00000335046 GIMAP5Q96F15 307 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2C-202ENST00000335046 SLC35A4Q96G79 324 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2C-202ENST00000335046 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2C-202ENST00000335046 DEPPQ9NTK1 212 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2C-202ENST00000335046 GIN1Q9NXP7 522 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2C-202ENST00000335046 BTNL2Q9UIR0 455 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2C-202ENST00000335046 REM1O75628 298 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 PGRP06401 933 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 KRT16P08779 473 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 IL12AP29459 219 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 MAP3K8P41279 467 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 GPR85P60893 370 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 PHC1P78364 1004 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 GUCY1A3Q02108 690 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 EFR3AQ14156 821 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 SPDYE7PQ495Y7 208 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 KRTCAP3Q53RY4 240 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 SZRD1Q7Z422 152 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 PRR22Q8IZ63 422 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 DIO2Q92813 273 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 TMBIM1Q969X1 311 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 TMCO6Q96DC7 493 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 COL21A1Q96P44 957 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 CBLCQ9ULV8 474 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 NBASA2RRP1 2371 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 TSPAN2O60636 221 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 NME6O75414 186 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 NKX2-2O95096 273 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 SNX4O95219 450 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 ZNF24P17028 368 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 IL12BP29460 328 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 PMP22Q01453 160 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 SNTA1Q13424 505 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 GAB1Q13480 694 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 DECR1Q16698 335 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 MFSD12Q6NUT3 480 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 OR5M3Q8NGP4 307 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 HGDQ93099 445 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 CCDC115Q96NT0 180 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 OR52E6Q96RD3 313 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 NPHS2Q9NP85 383 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 EQTNQ9NQ60 294 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 KCNH1O95259 989 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 WISP1O95388 367 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 CBX6O95503 412 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 ALOX5P09917 674 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 GABRA3P34903 492 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 ATP4BP51164 291 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 TDGF1P3P51864 188 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 CLECL1Q8IZS7 167 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 OR4A15Q8NGL6 344 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 MARK4Q96L34 752 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 STACQ99469 402 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 ANGPTL4Q9BY76 406 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 ACTRT3Q9BYD9 372 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 DUSP22Q9NRW4 184 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 FAM234BA2RU67 622 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 ACOT7O00154 380 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 UGT2B11O75310 529 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 UQCRC2P22695 453 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 PIGAP37287 484 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 CASP3P42574 277 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 KCNJ2P63252 427 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 PLGLB1Q02325 96 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 TP53BP2Q13625 1128 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 HYAL4Q2M3T9 481 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 SLC30A6Q6NXT4 461 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 CDC73Q6P1J9 531 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 SLC22A16Q86VW1 577 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2C-202ENST00000335046 OR4N2Q8NGD1 307 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms