RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 OR4Q3Q8NH05 313 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 SLC35G5Q96KT7 338 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 NEUROD4Q9HD90 331 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 ACP5P13686 325 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 GNSP15586 552 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 MMP12P39900 470 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 IDNKQ5T6J7 187 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 BCL2L15Q5TBC7 163 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 ZNF767PQ75MW2 155 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 DPPA4Q7L190 304 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 C7orf57Q8NEG2 295 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 MS4A8Q9BY19 250 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 GLIPR2Q9H4G4 154 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 NARFLQ9H6Q4 476 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 ISYNA1Q9NPH2 558 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 MOSPD1Q9UJG1 213 aa23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SENP3-201ENST00000321337 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 COL4A3Q01955 1670 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 GSAPA4D1B5 854 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 FAM170BA6NMN3 283 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 SGK494L7N484 410 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 TRIM23P36406 574 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 CCR2P41597 374 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 A0A1W2PS29 197 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 SYPP08247 313 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 PKLRP30613 574 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 SDE2Q6IQ49 451 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 PHF21AQ96BD5 680 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 MRGPRX3Q96LB0 322 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 PRRC1Q96M27 445 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 LIPT1Q9Y234 373 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 ASF1AQ9Y294 204 aa23.76■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 TRAV6A0A075B6T7 132 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 POP7O75817 140 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 TYRP14679 529 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 NDUFA9Q16795 377 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 KIAA1211LQ6NV74 962 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 H7BY64 318 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 CHP2O43745 196 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 ENPP1P22413 925 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 ACADLP28330 430 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 FRKP42685 505 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 SRP9P49458 86 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 UBE3DQ7Z6J8 389 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 TTC9Q92623 222 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 C16orf58Q96GQ5 468 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 PRAP1Q96NZ9 151 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 SEMA4GQ9NTN9 838 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa23.75■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 ESCO2Q56NI9 601 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 FAM27D1Q5T7N8 215 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 RAET1GQ6H3X3 334 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 MACROD1Q9BQ69 325 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 AHSPQ9NZD4 102 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 FAM183AA6NL82 134 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 HLA-DPB1P04440 258 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 RB1P06400 928 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 NNMTP40261 264 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 TOR2AQ5JU69 321 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 LHX8Q68G74 356 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 MRGPREQ86SM8 312 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 KRT78Q8N1N4 520 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 POGLUT1Q8NBL1 392 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 OR11H4Q8NGC9 324 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 UBE2E3Q969T4 207 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 IL36AQ9UHA7 158 aa23.74■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 SOCS6O14544 535 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 PI15O43692 258 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 SYN1P17600 705 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 SLC6A1P30531 599 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 RIN1Q13671 783 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 ZNF805Q5CZA5 627 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 AADACL4Q5VUY2 407 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 OR11H7Q8NGC8 314 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 OTULINQ96BN8 352 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms