RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 RAB8AP61006 207 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 TNFRSF17Q02223 184 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 RAB40BQ12829 278 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF311Q5JNZ3 666 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 FAM111BQ6SJ93 734 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 TRIM69Q86WT6 500 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 VRK2Q86Y07 508 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 PIK3R3Q92569 461 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 SLC6A17Q9H1V8 727 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 EGLN3Q9H6Z9 239 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 KLHL20Q9Y2M5 609 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 V9GYH0 126 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 CTDSP2O14595 271 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 TNFSF14O43557 240 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 NARSO43776 548 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 NR2F6P10588 404 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 SPNP16150 400 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 COL9A1P20849 921 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 KRT33BQ14525 404 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 TRAM2Q15035 370 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 MINDY4Q4G0A6 757 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 FRRS1Q6ZNA5 592 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 FLCNQ8NFG4 579 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 ASB15Q8WXK1 588 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 SLC35A4Q96G79 324 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 ANKRA2Q9H9E1 313 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 GIMAP4Q9NUV9 329 aa12.92□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 BTN3A3O00478 584 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 NDUFS1P28331 727 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 SEC13P55735 322 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 LTB4RQ15722 352 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 C9orf50Q5SZB4 431 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 MFSD12Q6NUT3 480 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 CDC73Q6P1J9 531 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 SLC27A4Q6P1M0 643 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 SLC36A4Q6YBV0 504 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 OR2L13Q8N349 312 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 KCT2Q8NC54 265 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 CNPPD1Q9BV87 410 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 MCOLN1Q9GZU1 580 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 NUAK2Q9H093 628 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 SAP130Q9H0E3 1048 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 IRGMA1A4Y4 181 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 C10orf142B7Z368 130 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 NTSR1P30989 418 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 PDX1P52945 283 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 DECR1Q16698 335 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 KLHL22Q53GT1 634 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 POC5Q8NA72 575 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 OR7G2Q8NG99 324 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 OR1E3Q8WZA6 343 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 MS4A4EQ96PG1 132 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 SLC30A2Q9BRI3 323 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF649Q9BS31 505 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 CERS4Q9HA82 394 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 POM121BA6NF01 834 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 WWP2O00308 870 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 MYL12BO14950 172 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 FPR3P25089 353 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 TNFSF8P32971 234 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 WNT4P56705 351 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 TAS2R41P59536 307 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 PSPHP78330 225 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 TGM3Q08188 693 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 ST3GAL3Q11203 375 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 TJAP1Q5JTD0 557 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 ANKRD54Q6NXT1 300 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 FBXO42Q6P3S6 717 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 ASPGQ86U10 573 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 OR2A5Q96R48 311 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 MED18Q9BUE0 208 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 PRR14Q9BWN1 585 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 IL20Q9NYY1 176 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF229Q9UJW7 825 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 EPOPA6NHQ4 379 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 FAM170BA6NMN3 283 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 H3BQ06 376 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 IL1AP01583 271 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 MSL3P1P0C860 447 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 LAMP2P13473 410 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 EN2P19622 333 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 BTN3A2P78410 334 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 SELENBP1Q13228 472 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 TPBGQ13641 420 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 C1DQ13901 141 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4C-201ENST00000317868 NFATC4Q14934 902 aa12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms