RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 GNA13Q14344 377 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 VWA2Q5GFL6 755 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNJQ5T5M9 372 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PIK3R3Q92569 461 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1F2PQ96R84 312 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SDF2Q99470 211 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 D6RAR5 112 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GDF9O60383 454 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 HPRP00739 348 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 LYNP07948 512 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 FPR1P21462 350 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNC4Q03721 635 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT73Q86Y46 540 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CDRT4Q8N9R6 151 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4C15Q8NGM1 316 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXL20Q96IG2 436 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 EPYCQ99645 322 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 Q9H521 79 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 REEP1Q9H902 201 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 FANCEQ9HB96 536 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MKLN1Q9UL63 735 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJB5O75953 348 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CLPSP04118 112 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 DAPP51397 102 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PSG6Q00889 435 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ACY1Q03154 408 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 COX15Q7KZN9 410 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 TSLPQ969D9 159 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 NRBF2Q96F24 287 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PTCHD1Q96NR3 888 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 DGAT2Q96PD7 388 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF347Q96SE7 839 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MBOAT4Q96T53 435 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 APMAPQ9HDC9 416 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 ACER3Q9NUN7 267 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 EXD2Q9NVH0 621 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CDC14AQ9UNH5 594 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 KIF26BQ2KJY2 2108 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 AGR2O95994 175 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 IFNW1P05000 195 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GRK6P43250 576 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 LIMS1P48059 325 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MAPK10P53779 464 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXL2P58012 376 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 RHAGQ02094 409 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 FUT7Q11130 342 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 VRK2Q86Y07 508 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PROX1Q92786 737 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 STACQ99469 402 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PIP5K1AQ99755 562 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 KCND3Q9UK17 655 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 GXYLT2A0PJZ3 443 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 M0R3H8 397 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms