RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 COMMD7Q86VX2 200 aa16.18■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 OR5AR1Q8NGP9 310 aa16.18■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 OSGIN1Q9UJX0 560 aa16.18■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 FEZF1A0PJY2 475 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 HPGDSO60760 199 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 TNFP01375 233 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 LHCGRP22888 699 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 DDOSTP39656 456 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 FAPQ12884 760 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 GPR68Q15743 365 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 SYNPOQ8N3V7 929 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 FTMTQ8N4E7 242 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 KLHDC7BQ96G42 594 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 TAS2R10Q9NYW0 307 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 OR14I1A6ND48 311 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 GPR37L1O60883 481 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 B3GALT4O96024 378 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 CFIP05156 583 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 S100A6P06703 90 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ASGR2P07307 311 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 C1SP09871 688 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ITGB7P26010 798 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 MFSD4AQ8N468 514 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ACBD7Q8N6N7 88 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 WDR48Q8TAF3 677 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 RNF31Q96EP0 1072 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 CD180Q99467 661 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 CDADC1Q9BWV3 514 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 SCN4AP35499 1836 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 A0A075B6Q4 140 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 FLRT2O43155 660 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 GMFGO60234 142 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 GPX2P18283 190 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ACVR1Q04771 509 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 TCTN1Q2MV58 587 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 F2RL3Q96RI0 385 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 MCHR1Q99705 422 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 PLXNB2O15031 1838 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 NDUFS1P28331 727 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 RPS19P39019 145 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 OR3A3P47888 321 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 SNTA1Q13424 505 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 C4orf46Q504U0 113 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 OR2G6Q5TZ20 316 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ACOT12Q8WYK0 555 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ALG5Q9Y673 324 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1B0GVC2 190 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 A6NIN4 97 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H2ABP04908 130 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 HBA1P69905 142 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 POU4F3Q15319 338 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 C16orf78Q8WTQ4 265 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 RLN3Q8WXF3 142 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H2ACQ93077 130 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 CDH10Q9Y6N8 788 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 DUXAA6NLW8 204 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ANXA2P2A6NMY6 339 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 FCER2P06734 321 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ID2Q02363 134 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 FAM205BPQ63HN1 556 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 GRHL2Q6ISB3 625 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 LMX1AQ8TE12 382 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 DTD2Q96FN9 168 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 WDR92Q96MX6 357 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 IL20RAQ9UHF4 553 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 M0R3H8 397 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ACVR1BP36896 505 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 GCGRP47871 477 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 SLAMF1Q13291 335 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 ANKK1Q8NFD2 765 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 DPH7Q9BTV6 452 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 HRASLS2Q9NWW9 162 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 VNN3Q9NY84 501 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 CPED1A4D0V7 1026 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 PDCD5O14737 125 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 GNB5O14775 395 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 TAPBPO15533 448 aa16.15■□□□□ 0.18
TRPC1-201ENST00000273482 RCBTB2O95199 551 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms