RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000232888.6

RRP9-201, Transcript of ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRP9, Length 1,578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9-201ENST00000232888 STX11O75558 287 aa22.16■■□□□ 1.14
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RRP9-201ENST00000232888 PDX1P52945 283 aa22.16■■□□□ 1.14
RRP9-201ENST00000232888 SPIBQ01892 262 aa22.16■■□□□ 1.14
RRP9-201ENST00000232888 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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RRP9-201ENST00000232888 SMOC1Q9H4F8 434 aa22.16■■□□□ 1.14
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RRP9-201ENST00000232888 SLC13A4Q9UKG4 626 aa22.16■■□□□ 1.14
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RRP9-201ENST00000232888 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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RRP9-201ENST00000232888 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa22.15■■□□□ 1.14
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RRP9-201ENST00000232888 RORAP35398 523 aa22.14■■□□□ 1.13
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RRP9-201ENST00000232888 DHRS1Q96LJ7 313 aa22.14■■□□□ 1.13
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RRP9-201ENST00000232888 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RRP9-201ENST00000232888 SPTBP11277 2137 aa22.13■■□□□ 1.13
RRP9-201ENST00000232888 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.13■■□□□ 1.13
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RRP9-201ENST00000232888 ANXA8P13928 327 aa22.13■■□□□ 1.13
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RRP9-201ENST00000232888 SCRG1O75711 98 aa22.12■■□□□ 1.13
RRP9-201ENST00000232888 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RRP9-201ENST00000232888 DBIP07108 87 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RRP9-201ENST00000232888 FGF5P12034 268 aa22.12■■□□□ 1.13
RRP9-201ENST00000232888 DAPP51397 102 aa22.12■■□□□ 1.13
RRP9-201ENST00000232888 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.12■■□□□ 1.13
RRP9-201ENST00000232888 EIPR1Q53HC9 387 aa22.12■■□□□ 1.13
RRP9-201ENST00000232888 C1orf189Q5VU69 101 aa22.12■■□□□ 1.13
RRP9-201ENST00000232888 AGBL5Q8NDL9 886 aa22.12■■□□□ 1.13
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