RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028386.11

Nckap1-201, Transcript of Nck-associated protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nckap1, Length 4,469 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Q810M1 233 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Dcaf12l2Q8BGW4 469 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cyp51a1Q8K0C4 503 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Osgin1Q8VC10 478 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Efcab7Q8VDY4 628 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr672Q8VG28 312 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 4933436I01RikQ9D3T1 429 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Yae1d1Q9DAY6 216 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Sac3d1A6H687 427 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Akirin2B1AXD8 201 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vmn2r90E9PXJ8 863 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 P03987 398 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Lrrc3P59034 257 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Baiap2Q8BKX1 535 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 MastlQ8C0P0 865 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Lrrc69Q9D9Q0 347 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tnfrsf22Q9ER62 198 aa20.01■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mterf1bB9EJ57 379 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vmn1r77E9PY60 306 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cdh19E9Q3A7 770 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 CtssO70370 340 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 DdcO88533 480 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 P01644 108 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 P01645 108 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 P01646 108 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 P01647 108 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ebf1Q07802 591 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Taar7aQ5QD12 358 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tas2r117Q7M715 330 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc22a6Q8VC69 545 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rad18Q9QXK2 509 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tcf7l1Q9Z1J1 584 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Fam46aD3Z5S8 447 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 TrhrP21761 393 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Uap1l1Q3TW96 507 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Orm3Q63805 206 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr309Q7TS01 308 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rbm45Q8BHN5 476 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rhbdd3Q8BP97 385 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vmn1r87Q8R255 295 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Pdia2D3Z6P0 527 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vmn1r31L7N2F1 303 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Alox8O35936 677 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Dsc3P55850 896 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 AgrpP56473 131 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Polr2mQ6P6I6 366 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Lrrtm3Q8BZ81 582 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Neto1Q8R4I7 533 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Med11Q9D8C6 117 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zbp1Q9QY24 411 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Hoxb13P70321 286 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 HlxQ61670 476 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Znf770Q8BIQ8 705 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Pycr1Q922W5 309 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Lamtor5Q9D1L9 91 aa20■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Fam136b-psA0A140T8T1 138 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm20431E9PY39 371 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 P04213 122 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Carns1Q6ZPS2 827 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Nipal3Q8BGN5 410 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tma7Q8K003 64 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zfp65Q91W94 390 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Timm22Q9CQ85 194 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tmem174Q9DCX7 243 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Greb1lB9EJV3 1913 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Acbd4E9Q289 327 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 FaimlJ3QPY3 178 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zfp934K7N6H3 473 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ubfd1Q78JW9 368 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Spata33Q8C624 132 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr77Q8VEY9 312 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 L3hypdhQ9CXA2 354 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cmss1Q9CZT6 276 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Stard5Q9EPQ7 213 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 H2afb1S4R1E0 115 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 H2afb3S4R1G7 115 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vmn1r184E9Q2N4 314 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vmn2r48E9Q5D8 855 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cldn4O35054 210 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tssk2O54863 358 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 OxtrP97926 388 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Hif3aQ0VBL6 662 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Havcr1Q5QNS5 305 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 ItpaQ9D892 198 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr930Q9EQ99 308 aa19.99■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr839-ps1A0A1D5RMH6 312 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 4930579F01RikE9Q3L6 325 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Obox6G3X9U1 347 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ctla4P09793 223 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gpr52P0C5J4 361 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cma1P21844 247 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Stt3aP46978 705 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Wdr75Q3U821 830 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Wdr45Q91VM3 360 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Nol3Q9D1X0 220 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Il23aQ9EQ14 196 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mast2Q60592 1734 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 S100a2J3QMC7 104 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gpx3P46412 226 aa19.98■□□□□ 0.79
Nckap1-201ENSMUST00000028386 AcadlP51174 430 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 78.5 ms