RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC26A5P58743 744 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CEACAM7Q14002 265 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR180Q86V85 440 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 LGI4Q8N135 537 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM178AQ8NBL3 297 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NT5CQ8TCD5 201 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ELP5Q8TE02 316 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52E6Q96RD3 313 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3GL1Q99961 368 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 VKORC1Q9BQB6 163 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 HRH3Q9Y5N1 445 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 C9JVG2 144 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PLPP1O14494 284 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNH1O95259 989 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE7AQ13946 482 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 LRIF1Q5T3J3 769 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM71E1Q6IPT2 247 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 GHDCQ8N2G8 530 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 MARVELD2Q8N4S9 558 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 OR8J3Q8NGG0 315 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 JADE3Q92613 823 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ITCHQ96J02 903 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 F2RL3Q96RI0 385 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 RBCK1Q9BYM8 510 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 REEP4Q9H6H4 257 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 LRFN1Q9P244 771 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NME2P1O60361 137 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SCN2BO60939 215 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V1G2O95670 118 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD17B1P14061 328 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NME2P22392 152 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 HPCAL1P37235 193 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PHC1P78364 1004 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ANXA8L1Q5VT79 327 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf146Q5VVC0 180 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC2A7Q6PXP3 512 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 DHDDSQ86SQ9 333 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC5A8Q8N695 610 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS37AQ8NEZ2 397 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR60Q8WVS4 1066 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CGREF1Q99674 301 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TBCDQ9BTW9 1192 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 EBPLQ9BY08 206 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CDCP1Q9H5V8 836 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ATAD3AQ9NVI7 634 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ADA2Q9NZK5 511 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 GMEB1Q9Y692 573 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A096LPI6 279 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF860A6NHJ4 632 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFS4O43181 175 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 KLK1P06870 262 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ABOP16442 354 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGER1P34995 402 aa22.35■■□□□ 1.17
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CAPNS1-216ENST00000628306 HYAL2Q12891 473 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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CAPNS1-216ENST00000628306 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4C11Q6IEV9 310 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NANOGP8Q6NSW7 305 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 AAGABQ6PD74 315 aa22.35■■□□□ 1.17
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CAPNS1-216ENST00000628306 UBE3DQ7Z6J8 389 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT13Q86X67 352 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CLHC1Q8NHS4 586 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB9Q96DX5 294 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PEX11GQ96HA9 241 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 LPAR4Q99677 370 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A16Q9GZN6 736 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NANOGQ9H9S0 305 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKHQ9HCJ1 492 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 BTNL2Q9UIR0 455 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A7Q9Y694 548 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A12O75746 678 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A2P52569 658 aa22.34■■□□□ 1.17
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