RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 NTNG2Q96CW9 530 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 Q96MF0 132 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 SFXN2Q96NB2 322 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 OR2B2Q9GZK3 357 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 ESYT3A0FGR9 886 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PLOD2O00469 737 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 FAM27E3Q08E93 113 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 ACAP2Q15057 778 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 KLC3Q6P597 504 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PERPQ96FX8 193 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 COX4I2Q96KJ9 171 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 MDFIQ99750 246 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PLLPQ9Y342 182 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.69□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 A0A1W2PNV4 684 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 OR7A17O14581 309 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 ACOX3O15254 700 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 GUCY1B2O75343 617 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 REM1O75628 298 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 TNFSF13O75888 250 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 TGM6O95932 706 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 CHMP24386 653 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PHBP35232 272 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 LHX2P50458 406 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 CCNG1P51959 295 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 GFRA1P56159 465 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 MGAT2Q10469 447 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 MAP4K2Q12851 820 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 IFT88Q13099 833 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 FRG2Q64ET8 278 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 TMBIM1Q969X1 311 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 KLHL29Q96CT2 875 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 TMCO6Q96DC7 493 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 FRG2BQ96QU4 278 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 UCN2Q96RP3 112 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 CCL19Q99731 98 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PIP5K1AQ99755 562 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 MED18Q9BUE0 208 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 BDH2Q9BUT1 245 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 DKKL1Q9UK85 242 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 DOCK7Q96N67 2140 aa14.68□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 A0A096LPK6 155 aa14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 C1orf226A1L170 272 aa14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 HMX2A2RU54 273 aa14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 MSTNO14793 375 aa14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 KLHL2O95198 593 aa14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 ATP1B1P05026 303 aa14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 DRD5P21918 477 aa14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 SRD5A2P31213 254 aa14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 ALDH9A1P49189 494 aa14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PPP2R2BQ00005 443 aa14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 HMGCS1Q01581 520 aa14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 ACKR1Q16570 336 aa14.67□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms