RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1W2PPB8	328 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1W2PRS3	328 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	C2orf74	A8MZ97	194 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768		G3V3Y1	287 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768		G3V4G9	280 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	NDC80	O14777	642 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	HS3ST1	O14792	307 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	MFSD11	O43934	449 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TMCC2	O75069	709 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SOCS5	O75159	536 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PROSC	O94903	275 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	CDK14	O94921	469 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PSG1	P11464	419 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	VCL	P18206	1134 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	CCKAR	P32238	428 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SOX2	P48431	317 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PRIM2	P49643	509 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	AIF1	P55008	147 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TPI1	P60174	286 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	AP1S1	P61966	158 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	GGTLC2	Q14390	218 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TAZ	Q16635	292 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	LCN9	Q8WX39	176 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	RAPGEF5	Q92565	580 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	HSPH1	Q92598	858 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ASB8	Q9H765	288 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	FREM3	P0C091	2139 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	DFFA	O00273	331 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	APOL1	O14791	398 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	KPNA5	O15131	536 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PGLS	O95336	258 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	IGHG3	P01860	377 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SLC25A16	P16260	332 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	UGT2B7	P16662	529 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	NDUFS1	P28331	727 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	GJC1	P36383	396 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	STT3A	P46977	705 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	HCAR3	P49019	387 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	CDH6	P55285	790 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	HILS1	P60008	231 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	GBE1	Q04446	702 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	GAB1	Q13480	694 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PARP15	Q460N3	678 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM205	Q6UW68	189 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.36	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms