RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SLCO4A1Q96BD0 722 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 YY1AP1Q9H869 796 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SATB2Q9UPW6 733 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC28A2O43868 658 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PGM3O95394 542 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNYL3P0C7X3 344 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC5A2P31639 672 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 EMDP50402 254 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PGDP52209 483 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRNB3Q05901 458 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC34A1Q06495 639 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 LCN10Q6JVE6 187 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT6Q8NCL4 622 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SIMC1Q8NDZ2 872 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC9A6Q92581 669 aa28.9■■■□□ 2.22
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CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35A4Q96G79 324 aa28.9■■■□□ 2.22
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF607Q96SK3 696 aa28.9■■■□□ 2.22
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CAPNS1-206ENST00000588815 OR10A5Q9H207 317 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 PADI1Q9ULC6 663 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 AURKCQ9UQB9 309 aa28.9■■■□□ 2.22
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CAPNS1-206ENST00000588815 RAP2AP10114 183 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ACP2P11117 423 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 FCGR1AP12314 374 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 MAPK11Q15759 364 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 C3orf38Q5JPI3 329 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TBCELQ5QJ74 424 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 C16orf62Q7Z3J2 963 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 MORN4Q8NDC4 146 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO30Q8TB52 745 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 RASSF5Q8WWW0 418 aa28.89■■■□□ 2.22
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CAPNS1-206ENST00000588815 FOLH1BQ9HBA9 442 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 STOML1Q9UBI4 398 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 C3orf18Q9UK00 162 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0G2JPF8 293 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC30A4O14863 429 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 BRINP1O60477 761 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 SSTR4P31391 388 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa28.88■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF615Q8N8J6 731 aa28.88■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa28.88■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf172C9J069 976 aa28.87■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD37Q7Z713 158 aa28.87■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 VSTM2LQ96N03 204 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC46A1Q96NT5 459 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 M0QX08 132 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SUV39H1O43463 412 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINB7O75635 380 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 BAG2O95816 211 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 AQP1P29972 269 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 HPCAP84074 193 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 FUT5Q11128 374 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 GPAT3Q53EU6 434 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CYBRD1Q53TN4 286 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT15Q8N3T1 639 aa28.86■■■□□ 2.21
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