RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 CT45A2Q5DJT8 189 aa30.57■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4A15Q8NGL6 344 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFXN5Q8TD22 340 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM125Q96AQ2 219 aa30.57■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CFAP46Q8IYW2 2715 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 GMNCA6NCL1 334 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC36A6NLP5 189 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPN14A8MX76 684 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa30.54■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDRT4Q8N9R6 151 aa30.54■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C5orf34Q96MH7 638 aa30.54■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR22Q8IZ63 422 aa30.52■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HES7Q9BYE0 225 aa30.52■■■□□ 2.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10H1Q9Y4A9 318 aa30.52■■■□□ 2.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUV39H1O43463 412 aa30.51■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC34A3Q8N130 599 aa30.51■■■□□ 2.47
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM107BQ9H098 131 aa30.51■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q9N2J8 555 aa30.51■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC154A6NI56 674 aa30.5■■■□□ 2.47
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