RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	ETV4	P43268	484 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SSR2	P43308	183 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PCYT1A	P49585	367 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ARFIP1	P53367	373 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PPP2R2B	Q00005	443 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ID2	Q02363	134 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	LCP2	Q13094	533 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	IFT88	Q13099	833 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	RCAN2	Q14206	197 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TBCC	Q15814	346 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NTRK2	Q16620	822 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	LIPJ	Q5W064	366 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	VASN	Q6EMK4	673 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	LYPD8	Q6UX82	237 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PACS2	Q86VP3	889 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	LAS2	Q8IYD9	372 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FAM13C	Q8NE31	585 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	METTL6	Q8TCB7	284 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	UCN3	Q969E3	161 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	UBE2E3	Q969T4	207 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	WDR34	Q96EX3	536 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FBXL20	Q96IG2	436 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZNF597	Q96LX8	424 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZNF382	Q96SR6	550 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	EBPL	Q9BY08	206 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PROK2	Q9HC23	129 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SENP1	Q9P0U3	644 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MID2	Q9UJV3	735 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688		H0YIV9	168 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PLPP1	O14494	284 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SMPD2	O60906	423 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	EED	O75530	441 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	HSPA4L	O95757	839 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ACTL6A	O96019	429 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FPR1	P21462	350 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GALNS	P34059	522 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CASP2	P42575	452 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MASP1	P48740	699 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TRPC1	P48995	793 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DNAJB13	P59910	316 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PHEX	P78562	749 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	6.26	□□□□□ -1.41	5e-17	■■■□□ 18.8
CS-233	ENST00000552688	GAB1	Q13480	694 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	RPS6KA2	Q15349	733 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688		Q5PR19	223 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FRG2	Q64ET8	278 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CROCCP2	Q86T23	111 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		6.26	□□□□□ -1.41

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