RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PLSCR2Q9NRY7 297 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ALKBH4Q9NXW9 302 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 GIMAP2Q9UG22 337 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 TMED5Q9Y3A6 229 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 CLDN16Q9Y5I7 305 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 RNF212BA8MTL3 300 aa12.72□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 TAS2R50P59544 299 aa12.72□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 SMU1Q2TAY7 513 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 Q5PR19 223 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 FBXW10Q5XX13 1052 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 FAM47EQ6ZV65 393 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ACAD11Q709F0 780 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 MAVSQ7Z434 540 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 HORMAD2Q8N7B1 307 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 C16orf52Q8NHV5 167 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ELP5Q8TE02 316 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 C16orf78Q8WTQ4 265 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 TANKQ92844 425 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PPP1R36Q96LQ0 422 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 Q96MF0 132 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PTCHD1Q96NR3 888 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 EBPLQ9BY08 206 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 CCDC134Q9H6E4 229 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 AKTIPQ9H8T0 292 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 WDR41Q9HAD4 459 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 NEUROD4Q9HD90 331 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 GLOD5A6NK44 160 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 TRPC5OSA6NMA1 111 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 WASHC1A8K0Z3 465 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 TGFBR3LH3BV60 316 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 SDHDO14521 159 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PGRMC2O15173 223 aa12.71□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 EDF1O60869 148 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 IL3P08700 152 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 NID1P14543 1247 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 SDC1P18827 310 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 HLCSP50747 726 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 OR4D2P58180 307 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ZNF763Q0D2J5 394 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 SLC13A2Q13183 592 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 EXT1Q16394 746 aa12.71□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 LRRC34Q8IZ02 419 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 FNDC5Q8NAU1 212 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 NAXEQ8NCW5 288 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 UCN3Q969E3 161 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 FAIM2Q9BWQ8 316 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 MYNNQ9NPC7 610 aa12.71□□□□□ -0.37
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CS-231ENST00000552222 CES1P1Q9UKY3 287 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 DNAJC13O75165 2243 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-231ENST00000552222 ZANQ9Y493 2812 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 C1orf226A1L170 272 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa12.7□□□□□ -0.38
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CS-231ENST00000552222 TGDSO95455 350 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 BCKDHAP12694 445 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 EPHA3P29320 983 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 PPP2R1BP30154 601 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 PPIAP62937 165 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 EMX2Q04743 252 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 HEPACAMQ14CZ8 416 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 FLYWCH1Q4VC44 716 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 FAM71E1Q6IPT2 247 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 SLC48A1Q6P1K1 146 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 SEM1Q6ZVN7 128 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 CLNKQ7Z7G1 428 aa12.7□□□□□ -0.38
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