RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 PLPP1O14494 284 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 PGRMC2O15173 223 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 ABCB7O75027 752 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 SLC35E2BP0CK96 405 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 SLC35E2P0CK97 266 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 ITGA2P17301 1181 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 GALNSP34059 522 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 CASP2P42575 452 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 HSPA7P48741 367 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 SNTA1Q13424 505 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 ELOA3BQ3SY89 546 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 LIPNQ5VXI9 398 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 CNTN4Q8IWV2 1026 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 GALNT12Q8IXK2 581 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 ZNF619Q8N2I2 560 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 ZNF525Q8N782 197 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 SNX31Q8N9S9 440 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 C7orf57Q8NEG2 295 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 ELOA3Q8NG57 546 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 S100PBPQ96BU1 408 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 DNAJC11Q9NVH1 559 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 DKKL1Q9UK85 242 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 ZNF337Q9Y3M9 751 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 EFCAB8A8MWE9 144 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 RAMP1O60894 148 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 TNFRSF21O75509 655 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 CD3EP07766 207 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 PCNAP12004 261 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 NAGAP17050 411 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 NEK2P51955 445 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 NUDT6P53370 316 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 PLCXD2Q0VAA5 305 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 CHIT1Q13231 466 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 TMEM35AQ53FP2 167 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 DEPDC1Q5TB30 811 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 DTX2Q86UW9 622 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 MCUQ8NE86 351 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 C17orf47Q8NEP4 570 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 EFCAB11Q9BUY7 163 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 TRIM2Q9C040 744 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 MS4A12Q9NXJ0 267 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 PHF11Q9UIL8 331 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-230ENST00000551968 DPRXA6NFQ7 191 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 NME6O75414 186 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 NTN1O95631 604 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 NR2F6P10588 404 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 PEPDP12955 493 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 GAS1P54826 345 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 C21orf58P58505 322 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 BSPH1Q075Z2 132 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 MGAT2Q10469 447 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 FGFBP1Q14512 234 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 FAM45BPQ6NSW5 357 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 TTC27Q6P3X3 843 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 FAM111BQ6SJ93 734 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 CLEC2AQ6UVW9 174 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 FRA10AC1Q70Z53 315 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 GPSM1Q86YR5 675 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 IGDCC3Q8IVU1 814 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 SPATA6LQ8N4H0 392 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 FAM45AQ8TCE6 357 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 DESI2Q9BSY9 194 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 FOLH1BQ9HBA9 442 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 WHRNQ9P202 907 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 ZNF175Q9Y473 711 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 A0A0A6YYD5 115 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 KRT14P02533 472 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 GBAP04062 536 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 EPB42P16452 691 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 PGAM1P18669 254 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 GRK2P25098 689 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 GGT5P36269 586 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 IRF8Q02556 426 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 E2F2Q14209 437 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 TGFBIQ15582 683 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 TAB1Q15750 504 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 PDK4Q16654 411 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 LAS2Q8IYD9 372 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 DEPDC4Q8N2C3 294 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 OR7G3Q8NG95 312 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 OR6K3Q8NGY3 331 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 TMBIM1Q969X1 311 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms