RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	ACOX3	O15254	700 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	ACTL6A	O96019	429 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CHN1	P15882	459 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	DRD5	P21918	477 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	OPRM1	P35372	400 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	PPIC	P45877	212 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CLC	Q05315	142 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	FOXF2	Q12947	444 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	SNTA1	Q13424	505 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	TEX35	Q5T0J7	233 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	RDH11	Q8TC12	318 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	FMO2	Q99518	471 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	PSME2	Q9UL46	239 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	MTOR	P42345	2549 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	T	O15178	435 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CBR3	O75828	277 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	IL18BP	O95998	194 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	IL3	P08700	152 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CT45A8	P0DMV1	189 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CT45A9	P0DMV2	189 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	EPX	P11678	715 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CYP4B1	P13584	511 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CPN1	P15169	458 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	KLK2	P20151	261 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	DNASE1	P24855	282 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	DCAF7	P61962	342 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	SRY	Q05066	204 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	RCAN2	Q14206	197 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	UNC50	Q53HI1	259 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	KIF18B	Q86Y91	864 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF675	Q8TD23	568 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	KAT2A	Q92830	837 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	TMBIM1	Q969X1	311 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	COL21A1	Q96P44	957 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	BTBD9	Q96Q07	612 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	PRODH2	Q9UF12	536 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	MCM8	Q9UJA3	840 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	VPS13C	Q709C8	3753 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	MED12	Q93074	2177 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110		B4DXG7	233 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110		H0Y3Z8	333 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	DLX3	O60479	287 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	TSPAN2	O60636	221 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	REM1	O75628	298 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	SUPT7L	O94864	414 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	ESRRB	O95718	433 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CTAGE8	P0CG41	777 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	HSD3B1	P14060	373 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	HSD3B2	P26439	372 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	GCA	P28676	217 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	STAR	P49675	285 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	HTR6	P50406	440 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	LHX2	P50458	406 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	DGKQ	P52824	942 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	GFRA1	P56159	465 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CORO7	P57737	925 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	HMGCS1	Q01581	520 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SNHG4-208	ENST00000514110	RASA2	Q15283	850 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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