RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 GVQW1Q8N7I0 195 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CNBD1Q8NA66 436 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 OR4D10Q8NGI6 311 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 DPF1Q92782 380 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 PNPLA2Q96AD5 504 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 MAGED4Q96JG8 741 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 ART5Q96L15 291 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 CAPNS2Q96L46 248 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 USP28Q96RU2 1077 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 AGPAT1Q99943 283 aa2.01□□□□□ -2.09
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PDE4D-218ENST00000509368 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 RNF186Q9NXI6 227 aa2.01□□□□□ -2.09
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PDE4D-218ENST00000509368 WNT16Q9UBV4 365 aa2.01□□□□□ -2.09
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PDE4D-218ENST00000509368 SLX4Q8IY92 1834 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-218ENST00000509368 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa2□□□□□ -2.09
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PDE4D-218ENST00000509368 AP4B1Q9Y6B7 739 aa2□□□□□ -2.09
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