RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIL	Q7L0X0	811 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR22	Q8IZ63	422 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	MMP21	Q8N119	569 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	RND1	Q92730	232 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PGM2	Q96G03	612 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	RILP	Q96NA2	401 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ZIM3	Q96PE6	472 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	MECR	Q9BV79	373 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF639	Q9UID6	485 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRK2	Q5S007	2527 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PS29	197 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PIP5K1B	O14986	540 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	T	O15178	435 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	AKAP10	O43572	662 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TYROBP	O43914	113 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SOX30	O94993	753 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN14	O95500	239 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHG3	P01860	377 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CLPS	P04118	112 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINE1	P05121	402 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	IFI6	P09912	130 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PNLIPRP2	P54317	469 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	LTB4R	Q15722	352 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CEBPE	Q15744	281 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CHI3L2	Q15782	390 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM107	Q6UX40	140 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TSSK3	Q96PN8	268 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	BTBD9	Q96Q07	612 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GVC2	190 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PINLYP	A6NC86	204 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PLOD2	O00469	737 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PEX11A	O75192	247 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CBR3	O75828	277 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	LRAT	O95237	230 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CBX7	O95931	251 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRNG	P07510	517 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT16	P08779	473 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	COX6B1	P14854	86 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	HPGD	P15428	266 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	S1PR1	P21453	382 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ACVR2A	P27037	513 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	HTR1E	P28566	365 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	MC3R	P41968	323 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CASP3	P42574	277 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PRIM2	P49643	509 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	EMD	P50402	254 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	MGAT2	Q10469	447 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPB3	Q12988	150 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	STX3	Q13277	289 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TP53BP2	Q13625	1128 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	GXYLT1	Q4G148	440 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	CPTP	Q5TA50	214 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ATG16L1	Q676U5	607 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TTLL3-231	ENST00000496246	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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