RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 EHD3Q9NZN3 535 aa12.1□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 DSCR3O14972 297 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 HOXB2P14652 356 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 UGT2B15P54855 530 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 HOXC5Q00444 222 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 ILKQ13418 452 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 TSTQ16762 297 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 VN1R4Q7Z5H5 301 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 C11orf74Q86VG3 221 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 LILRB4Q8NHJ6 448 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 NECTIN4Q96NY8 510 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 OR2M4Q96R27 311 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 PRRG3Q9BZD7 231 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 ACAD8Q9UKU7 415 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 MGAT4BQ9UQ53 548 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 SPTBP11277 2137 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 IDH3BO43837 385 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 UGT2B17O75795 530 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 F3P13726 295 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 DDX5P17844 614 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 MMP11P24347 488 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 CMPK1P30085 196 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 PPP2R1BP30154 601 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 S100A5P33763 92 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 TNFRSF4P43489 277 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 CCDC58Q4VC31 144 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 PLAG1Q6DJT9 500 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 ZNF425Q6IV72 752 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 LYPD8Q6UX82 237 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 IQCHQ86VS3 1027 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 AMIGO1Q86WK6 493 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 KRT73Q86Y46 540 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 MFSD9Q8NBP5 474 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 FNDC11Q9BVV2 318 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 CDADC1Q9BWV3 514 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 TMEM74BQ9NUR3 256 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 TVP23BQ9NYZ1 205 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-213ENST00000492657 EFCAB10A6NFE3 127 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 PROM1O43490 865 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 AHRP35869 848 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 UGT2B10P36537 528 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 KHKP50053 298 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CHRNEQ04844 493 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SLX4IPQ5VYV7 408 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SLC48A1Q6P1K1 146 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 PAQR6Q6TCH4 344 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 OR4N5Q8IXE1 308 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 OR4K5Q8NGD3 323 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SLC6A18Q96N87 628 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 MGLLQ99685 303 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 TMEM168Q9H0V1 697 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A19Q9HC21 320 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ERVK13-1Q9NX77 482 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 NTNG1Q9Y2I2 539 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CCRL2O00421 344 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 TFECO14948 347 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ACSL1P33121 698 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SLC15A1P46059 708 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 GSTM5P46439 218 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 MAN2A2P49641 1150 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ABATP80404 500 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 TEKQ02763 1124 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ACSM5Q6NUN0 579 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 VRK2Q86Y07 508 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 TMEFF1Q8IYR6 380 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 FRMD1Q8N878 549 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 TP53INP1Q96A56 240 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 COL26A1Q96A83 441 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 OR7D2Q96RA2 312 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CDCA4Q9BXL8 241 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ENTPD4Q9Y227 616 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 LGI1O95970 557 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SSX1Q16384 188 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 C12orf73Q69YU5 71 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 GDPD3Q7L5L3 318 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SFTPA2Q8IWL1 248 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 PARP16Q8N5Y8 322 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 NUP43Q8NFH3 380 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SIPA1Q96FS4 1042 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ZNF681Q96N22 645 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 NEDD4LQ96PU5 975 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 GABRG3Q99928 467 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ANKHQ9HCJ1 492 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ENOPH1Q9UHY7 261 aa12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms