RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC63Q8NA47 563 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM13CQ8NE31 585 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 C17orf47Q8NEP4 570 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 OR7G1Q8NGA0 311 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 OR2W6PQ8NHA6 318 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM57AQ8TBR7 257 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 PAQR8Q8TEZ7 354 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TP53INP1Q96A56 240 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 KLHL29Q96CT2 875 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 APIPQ96GX9 242 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 TTTY12Q9BZ98 90 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 OR10A5Q9H207 317 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 IL1RL2Q9HB29 575 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNJ16Q9NPI9 418 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 OXSMQ9NWU1 459 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 MKS1Q9NXB0 559 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 CNIH4Q9P003 139 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CTDSPL-208ENST00000486978 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 CAPN14A8MX76 684 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 CRCPO75575 148 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 PDE9AO76083 593 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 SLU7O95391 586 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 IGHG3P01860 377 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 RAF1P04049 648 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 IL3P08700 152 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 UROSP10746 265 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 CD53P19397 219 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 S1PR1P21453 382 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 GPX3P22352 226 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 MAGEA5P43359 124 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 GSTM5P46439 218 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 FOXA1P55317 472 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 NRG3P56975 720 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNJ2P63252 427 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 PPP2R2BQ00005 443 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 DUSP2Q05923 314 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 BTKQ06187 659 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 IFFO1Q0D2I5 559 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 FOXO1Q12778 655 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 HEPACAMQ14CZ8 416 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 PCLAFQ15004 111 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 RPS6KA2Q15349 733 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 IMPG1Q17R60 797 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 TBCELQ5QJ74 424 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 WDR93Q6P2C0 686 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 EMBQ6PCB8 327 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 SCIMPQ6UWF3 145 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 TRABD2AQ86V40 505 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM251Q8N6I4 163 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 C16orf78Q8WTQ4 265 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 CAVIN3Q969G5 261 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 ADIPOR1Q96A54 375 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 APOPT1Q96IL0 206 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF681Q96N22 645 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 EBPLQ9BY08 206 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 PFDN4Q9NQP4 134 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 GIMAP4Q9NUV9 329 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 COQ3Q9NZJ6 369 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 EHD3Q9NZN3 535 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 CRIM1Q9NZV1 1036 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 HEY2Q9UBP5 337 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 LGALS13Q9UHV8 139 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF639Q9UID6 485 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 UTS2RQ9UKP6 389 aa5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CTDSPL-208ENST00000486978 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms