RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 BMP7P18075 431 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CAPN3P20807 821 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GCAP28676 217 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 KIR2DL3P43628 341 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CDK9P50750 372 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DGKQP52824 942 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PRKAA2P54646 552 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 NAGLUP54802 743 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CORO7P57737 925 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MAP4K2Q12851 820 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 RCAN2Q14206 197 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 HSPB2Q16082 182 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SPIN4Q56A73 249 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ARSKQ6UWY0 536 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TMCO6Q96DC7 493 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TIMP4Q99727 224 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 UGT2B28Q9BY64 529 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MCM8Q9UJA3 840 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DOCK7Q96N67 2140 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 AHRRA9YTQ3 701 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 COPEO14579 308 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 AKAP10O43572 662 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GLRA3O75311 464 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SEC22BO75396 215 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CBX7O95931 251 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SHBGP04278 402 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ATP1B1P05026 303 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CYP4B1P13584 511 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 HSD3B1P14060 373 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DRD2P14416 443 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 S1PR1P21453 382 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 HSD3B2P26439 372 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 NTSP30990 170 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MPIP34949 423 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GPC1P35052 558 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PPICP45877 212 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CPA2P48052 419 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 STARP49675 285 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ART1P52961 327 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FOXA1P55317 472 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PKNOX1P55347 436 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TFF3Q07654 80 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MGAT2Q10469 447 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DCST1Q5T197 706 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CLEC6AQ6EIG7 209 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM107Q6UX40 140 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TIFABQ6ZNK6 161 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.37□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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