RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 PHF21BQ96EK2 531 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ART5Q96L15 291 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 F2RL3Q96RI0 385 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 CSF3RQ99062 836 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 TRMOQ9BU70 441 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 BDH2Q9BUT1 245 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM109Q9BVC6 243 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 UBQLN3Q9H347 655 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 CALHM2Q9HA72 323 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 WDR41Q9HAD4 459 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 SENP1Q9P0U3 644 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 LGALS13Q9UHV8 139 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 GRID1Q9ULK0 1009 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ARID1AO14497 2285 aa7□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 DYRK3O43781 588 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 DLX3O60479 287 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 GUCY1B2O75343 617 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ETHE1O95571 254 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 TGFB1P01137 390 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 KRT6AP02538 564 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 KRT6BP04259 564 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 IFNA16P05015 189 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 NR2F6P10588 404 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 CPN2P22792 545 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 BSGP35613 385 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 HSD17B3P37058 310 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 KRT6CP48668 564 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 VSNL1P62760 191 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 PLIN5Q00G26 463 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 CLCQ05315 142 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ASPHQ12797 758 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 STX4Q12846 297 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 NTRK2Q16620 822 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 Q5PR19 223 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 VASNQ6EMK4 673 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 MED12LQ86YW9 2145 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 METTL4Q8N3J2 472 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 PIGTQ969N2 578 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM237Q96Q45 408 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 EXO5Q9H790 373 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ASB4Q9Y574 426 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.99□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 DSCAMO60469 2012 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 A0A0G2JN53 185 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 OR6C76A6NM76 312 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 G3V2L1 256 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 H7C1Q1 480 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 PLIN3O60664 434 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 LDB3O75112 727 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 SNX4O95219 450 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 ESRRBO95718 433 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 PROCP04070 461 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 SHBGP04278 402 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 MYL2P10916 166 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 KRT15P19012 456 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 TNNI3P19429 210 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 SERPINB5P36952 375 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 STT3AP46977 705 aa6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RBBP4-211ENST00000477563 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms