RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473722.5

SCIN-205, Transcript of scinderin, human

TSL 4

Gene SCIN, Length 656 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCIN-205	ENST00000473722	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NUP205	Q92621	2012 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722		A0A087WYN8	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	DCX	O43602	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	BANF1	O75531	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GJB3	O75712	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TM7SF2	O76062	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	AP2A2	O94973	939 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	APBB3	O95704	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SLC4A1	P02730	911 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	UMOD	P07911	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ALPI	P09923	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TMEM11	P17152	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CD9	P21926	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NMBR	P28336	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TEAD1	P28347	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	P2RY2	P41231	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NSG1	P42857	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SLC1A2	P43004	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PTGER3	P43115	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SPINT3	P49223	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SERPINB8	P50452	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	LIMK2	P53671	638 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	DCAF7	P61962	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NFATC2	Q13469	925 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	GANC	Q8TET4	914 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CLDN23	Q96B33	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NUS1	Q96E22	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RBBP8	Q99708	897 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SHBG	P04278	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	PIRT	P0C851	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	LHCGR	P22888	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	CRABP2	P29373	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	HOXA6	P31267	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	FOXN2	P32314	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCIN-205	ENST00000473722	SLC26A3	P40879	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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