RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 NISCHQ9Y2I1 1504 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 FAM170AA1A519 330 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 FAM220BPB1ANY3 271 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 C11orf98E9PRG8 122 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 LYPD3O95274 346 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 APRTP07741 180 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 CD1EP15812 388 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 IGFBP5P24593 272 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 XCR1P46094 333 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
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SGCE-210ENST00000472326 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 CNTN4Q8IWV2 1026 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 GPR65Q8IYL9 337 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 MLKLQ8NB16 471 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 TMEM45BQ96B21 275 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 DNAJA3Q96EY1 480 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 CARD9Q9H257 536 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 STARD5Q9NSY2 213 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 LHX3Q9UBR4 397 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 FAM153AQ9UHL3 310 aa4.73□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 PTPRUQ92729 1446 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 SDC3O75056 442 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 GSTA1P08263 222 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 ALDH3B2P48448 385 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 SGSHP51688 502 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 ERICH1Q86X53 443 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 OR13F1Q8NGS4 319 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 COMMD8Q9NX08 183 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 TEX264Q9Y6I9 313 aa4.72□□□□□ -1.65
SGCE-210ENST00000472326 EPOPA6NHQ4 379 aa4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 ZFP92A6NM28 416 aa4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 H0Y9J4 135 aa4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 NME2P1O60361 137 aa4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 CYP11B1P15538 503 aa4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 STX17P56962 302 aa4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 BNIP1Q12981 228 aa4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 RPA4Q13156 261 aa4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 UNC45BQ8IWX7 931 aa4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 CEND1Q8N111 149 aa4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 KLHL21Q9UJP4 597 aa4.71□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
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SGCE-210ENST00000472326 SLC17A2O00624 439 aa4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 VEGFDO43915 354 aa4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 IGSF6O95976 241 aa4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 TMOD1P28289 359 aa4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 ZNF699Q32M78 642 aa4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 C2orf83Q53S99 150 aa4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 LIPKQ5VXJ0 399 aa4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 DLEU7Q6UYE1 221 aa4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 ELOVL4Q9GZR5 314 aa4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 MID1IP1Q9NPA3 183 aa4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 CLIP2Q9UDT6 1046 aa4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 TMEM89A2RUT3 159 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 LRIT2A6NDA9 550 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 H3BMH7 237 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 HSF2BPO75031 334 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 KRT6AP02538 564 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 KRT6BP04259 564 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 ABHD2P08910 425 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 KRT6CP48668 564 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 METAP1P53582 386 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 CASP9P55211 416 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 SRP54P61011 504 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 Q6ZVH6 145 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 AMZ2Q86W34 360 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 PEX5LQ8IYB4 626 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 CABS1Q96KC9 395 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 MAGEB18Q96M61 343 aa4.69□□□□□ -1.66
SGCE-210ENST00000472326 LINC00167Q96N53 147 aa4.69□□□□□ -1.66
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