RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472148.5

SLC13A3-210, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC13A3, Length 3,283 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-210ENST00000472148 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 POF1BQ8WVV4 589 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 NEURL3Q96EH8 262 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 MS4A8Q9BY19 250 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 DNAJB6O75190 326 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 NR2F6P10588 404 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 ACADLP28330 430 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 ILKQ13418 452 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 GPR50Q13585 617 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 NCF4Q15080 339 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 IDNKQ5T6J7 187 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 TRIQKQ629K1 86 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 LILRA6Q6PI73 481 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 TEX47Q8TBZ9 253 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 DNAJA3Q96EY1 480 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 AICDAQ9GZX7 198 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 KLHL1Q9NR64 748 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SEMA4GQ9NTN9 838 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 P2RX2Q9UBL9 471 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SERGEFQ9UGK8 458 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 CA5BQ9Y2D0 317 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 ISM1B1AKI9 464 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 E9PQ18 207 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 MEN1O00255 615 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 FAAHO00519 579 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 LILRB3O75022 631 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 RAB36O95755 333 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 GYPBP06028 91 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SYPP08247 313 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 CCL5P13501 91 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 PTPN2P17706 415 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 PPP2R1BP30154 601 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 CCR8P51685 355 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 HMGA2P52926 109 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SEC13P55735 322 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 DCDC1P59894 354 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SCN1BQ07699 218 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 HYAL2Q12891 473 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 NUDT13Q86X67 352 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 NRMQ8IXM6 262 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 TIGD4Q8IY51 512 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 COQ10AQ96MF6 247 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 GIMAP4Q9NUV9 329 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 HYKKA2RU49 373 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SH3D21A4FU49 640 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 CXCR2P25025 360 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 CDH11P55287 796 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 FUT5Q11128 374 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 ZNF234Q14588 700 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 GPR68Q15743 365 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 BCL2A1Q16548 175 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 MLIPQ5VWP3 458 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 TRIM69Q86WT6 500 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 Q8N402 240 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 KCT2Q8NC54 265 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 C19orf18Q8NEA5 215 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 TMEM255BQ8WV15 326 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 TMCO6Q96DC7 493 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 KCTD7Q96MP8 289 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 AMDHD1Q96NU7 426 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 GALNT9Q9HCQ5 603 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-210ENST00000472148 A0A0B4J203 849 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms