RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 DYRK3O43781 588 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC28A2O43868 658 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR10H2O60403 315 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 CBFA2T3O75081 653 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 NKX2-2O95096 273 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 FESP07332 822 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 ALOX5P09917 674 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF23P17027 643 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 RHCEP18577 417 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 NT5EP21589 574 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-202ENST00000444658 RPS6KA3P51812 740 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 DCDP81605 110 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 DAG1Q14118 895 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYPL1Q16563 259 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 DUSP7Q16829 419 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 RFX4Q33E94 735 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC16A11Q8NCK7 471 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM110BQ8TC76 370 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 NR4A3Q92570 626 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAB8BQ92930 207 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 WNT2BQ93097 391 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMBIM1Q969X1 311 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNBD2Q96M20 576 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 DGAT2Q96PD7 388 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR6C1Q96RD1 312 aa8.63□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-202ENST00000444658 ZPBPQ9BS86 351 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADI1Q9BV57 179 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 PINK1Q9BXM7 581 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRPC4Q9UBN4 977 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRODH2Q9UF12 536 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 CFL2Q9Y281 166 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 R4GN57 208 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0C4DFX4 3053 aa8.62□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-202ENST00000444658 LAMA1P25391 3075 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-202ENST00000444658 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.62□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-202ENST00000444658 EI24O14681 340 aa8.62□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-202ENST00000444658 DNAJB5O75953 348 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 H6PDO95479 791 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 CBX7O95931 251 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 LGI1O95970 557 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 ALPLP05186 524 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 BCHEP06276 602 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD63P08962 238 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD247P20963 164 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 CAPGP40121 348 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 EMDP50402 254 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 CASP9P55211 416 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 TUBA4AP68366 448 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 BTG2P78543 158 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 VLDLRP98155 873 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-202ENST00000444658 LTB4RQ15722 352 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSRP2Q16527 193 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 LPAL2Q16609 132 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRT80Q6KB66 452 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM111BQ6SJ93 734 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 USP51Q70EK9 711 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 OVCH1Q7RTY7 1134 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 BMPERQ8N8U9 685 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC35B4Q969S0 331 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 TPD52L3Q96J77 140 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 VPS50Q96JG6 964 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAGED4Q96JG8 741 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 ART5Q96L15 291 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTCHD1Q96NR3 888 aa8.62□□□□□ -1.03
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