RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR137Q96N19 417 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 DPY30Q9C005 99 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 C3orf14Q9HBI5 128 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 UQCRHLA0A096LP55 91 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD28O15084 1053 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP8B1O43520 1251 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCB7O75027 752 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TGDSO95455 350 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXW4P57775 412 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PSG6Q00889 435 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXO1Q12778 655 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM81Q6P7N7 255 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM47EQ6ZV65 393 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC34A3Q8N130 599 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM13CQ8NE31 585 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 OR8J2Q8NGG1 315 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NTNG2Q96CW9 530 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 OMA1Q96E52 524 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEB18Q96M61 343 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 DUSP26Q9BV47 211 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 IL1RL2Q9HB29 575 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PROK2Q9HC23 129 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 AIG1Q9NVV5 245 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC18AA5D8T8 446 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PINLYPA6NC86 204 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 OR6C70A6NIJ9 312 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NPIPA5E9PKD4 350 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 EMC8O43402 210 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ASNA1O43681 348 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 GLSO94925 669 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SNX4O95219 450 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 EPHA3P29320 983 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PIGAP37287 484 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP3K8P41279 467 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 CDK9P50750 372 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PLCXD2Q0VAA5 305 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NNATQ16517 81 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.071e-7■■■□□ 18.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP27C1Q4G0S4 372 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC18BQ6UXF7 455 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 GFRALQ6UXV0 394 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NPSR1Q6W5P4 371 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR22Q8IZ63 422 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC18CQ8NCF0 446 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 DIO2Q92813 273 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 HGDQ93099 445 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TESCQ96BS2 214 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC35A4Q96G79 324 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGED4Q96JG8 741 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ANGPTL4Q9BY76 406 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NPIPA1Q9UND3 350 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR45Q9Y5Y3 372 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 USH1CQ9Y6N9 552 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ACOT7O00154 380 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TSPAN2O60636 221 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 WISP2O76076 250 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 UNC5CO95185 931 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 DNASE1L1P49184 302 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PNLIPRP2P54317 469 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 CORO7P57737 925 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PPIAP62937 165 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR5P85299 388 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 EFR3AQ14156 821 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 DPY19L1Q2PZI1 675 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 EPGNQ6UW88 154 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 MAVSQ7Z434 540 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 CDRT4Q8N9R6 151 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NUP43Q8NFH3 380 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 OR5M3Q8NGP4 307 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR7Q8TB68 274 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NUDT8Q8WV74 236 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TMBIM1Q969X1 311 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 TTTY12Q9BZ98 90 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 NEUROD4Q9HD90 331 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0G2JMM0 328 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PPB8 328 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PRS3 328 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms