RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLIN5Q00G26 463 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3C-202ENST00000428892 TFF3Q07654 80 aa10□□□□□ -0.81
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APOBEC3C-202ENST00000428892 UGT3A2Q3SY77 523 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
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APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC48A1Q6P1K1 146 aa10□□□□□ -0.81
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa10□□□□□ -0.81
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APOBEC3C-202ENST00000428892 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
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APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC37A1P57057 533 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNF4P78317 190 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3C-202ENST00000428892 DUSP2Q05923 314 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACSM2AQ08AH3 577 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3C-202ENST00000428892 MGAT2Q10469 447 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3C-202ENST00000428892 FUT7Q11130 342 aa9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3C-202ENST00000428892 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.98□□□□□ -0.81
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