RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 FCARP24071 287 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 STARP49675 285 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 NCF4Q15080 339 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TEAD4Q15561 434 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 C11orf88Q6PI97 169 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 RRM2BQ7LG56 351 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SHISA5Q8N114 240 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 RNFT2Q96EX2 444 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CSF3RQ99062 836 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 WACQ9BTA9 647 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 DPH7Q9BTV6 452 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 IL21RQ9HBE5 538 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 A0A0B4J203 849 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 POM121CA8CG34 1229 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 C5orf58C9J3I9 102 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TXNL1O43396 289 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SOD1P00441 154 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 HOXA9P31269 272 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 AP1S2P56377 157 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TATDN3Q17R31 274 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 GAB4Q2WGN9 574 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 AMZ1Q400G9 498 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 AGBL4Q5VU57 503 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 PROSER1Q86XN7 944 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 NELL1Q92832 810 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ROPN1LQ96C74 230 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 BBS4Q96RK4 519 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 BEX1Q9HBH7 125 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 FZD4Q9ULV1 537 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.16□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 LRRC72A6NJI9 287 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 HMGN1P05114 100 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SSX2Q16385 188 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 LPAL2Q16609 132 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 XKR7Q5GH72 579 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 RNF130Q86XS8 419 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 USP7Q93009 1102 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 LYSMD1Q96S90 227 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 A0A1W2PS29 197 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 YY2O15391 372 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SSX4O60224 188 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 C7P10643 843 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 AMD1P17707 334 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 MVKQ03426 396 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 NAGSQ8N159 534 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 KRT78Q8N1N4 520 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 COQ10AQ96MF6 247 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 DOK1Q99704 481 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 ZIM2Q9NZV7 527 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SSR3Q9UNL2 185 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
ACTBP13-201ENST00000423971 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
ACTBP13-201ENST00000423971 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.15□□□□□ -1.11
ACTBP13-201ENST00000423971 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.15□□□□□ -1.11
ACTBP13-201ENST00000423971 K7EQS6 105 aa8.15□□□□□ -1.11
ACTBP13-201ENST00000423971 TO15178 435 aa8.15□□□□□ -1.11
ACTBP13-201ENST00000423971 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
ACTBP13-201ENST00000423971 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.15□□□□□ -1.11
ACTBP13-201ENST00000423971 NDUFV2P19404 249 aa8.15□□□□□ -1.11
ACTBP13-201ENST00000423971 DNASE1P24855 282 aa8.15□□□□□ -1.11
ACTBP13-201ENST00000423971 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms