RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 UCK2Q9BZX2 261 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR70Q9NW82 654 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MEN1O00255 615 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PIN1P1O15428 100 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PTP4A3O75365 173 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT1P36639 197 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EPHA4P54764 986 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 REEP5Q00765 189 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MINDY4Q4G0A6 757 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FHL5Q5TD97 284 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ANXA8L1Q5VT79 327 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MFSD14CQ5VZR4 134 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT12Q8IXK2 581 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ASIC4Q96FT7 647 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SCLYQ96I15 445 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP6Q96JE9 813 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF354BQ96LW1 612 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RACGAP1Q9H0H5 632 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNMB2Q9Y691 235 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 STON1Q9Y6Q2 735 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NUP210LQ5VU65 1888 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LEFTY2O00292 366 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 BHLHE40O14503 412 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GNGT2O14610 69 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HCN1O60741 890 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FPR3P25089 353 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NOS3P29474 1203 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRA5P31644 462 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPK14Q16539 360 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf64Q5T6V5 341 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF544Q6NX49 715 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 THAP4Q8WY91 577 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SMPDL3AQ92484 453 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RBP7Q96R05 134 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MCUBQ9NWR8 336 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP97Q9P2B7 532 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PILRAQ9UKJ1 303 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CORO2BQ9UQ03 480 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNE2Q9Y6J6 123 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PRRT4C9JH25 899 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NPIPB9F8W1W9 429 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MPZL2O60487 215 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GADD45GO95257 159 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CFPP27918 469 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX9P48436 509 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MTNR1BP49286 362 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR176Q14439 515 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RAET1GQ6H3X3 334 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C6orf120Q7Z4R8 191 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RGMAQ96B86 450 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF524Q96C55 264 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 BEX2Q9BXY8 128 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TDP1Q9NUW8 608 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CD84Q9UIB8 345 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PRB8 838 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2M5A3KFT3 312 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TGM5O43548 720 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RFPL3O75679 317 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HPXP02790 462 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GJA1P17302 382 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 M6PRP20645 277 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CAV3P56539 151 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC42P60953 191 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1841Q6NSI8 718 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LCTLQ6UWM7 567 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00114Q6XXX2 140 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LNX2Q8N448 690 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 STX19Q8N4C7 294 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR156Q8NFN8 814 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR11H7Q8NGC8 314 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNRF4Q8WWF5 429 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 COQ7Q99807 217 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TSSK6Q9BXA6 273 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNA1EQ15878 2313 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LEUTXA8MZ59 168 aa3.39□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ANHXE9PGG2 379 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms