RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa5.64□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SNX8Q9Y5X2 465 aa5.64□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa5.64□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 RNF215Q9Y6U7 377 aa5.64□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.64□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa5.64□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ABCA7Q8IZY2 2146 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM131Q92545 1883 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0G2JPF8 293 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1B0GTQ1 180 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 H3BNH8 94 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SLC16A6O15403 523 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 B4GAT1O43505 415 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PLOD3O60568 738 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SDC3O75056 442 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJB5O75953 348 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TNFAIP8O95379 198 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 NSA2O95478 260 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SNAP29O95721 258 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 GPR75O95800 540 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CTSBP07858 339 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 GUSBP08236 651 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 THRBP10828 461 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ITGAMP11215 1152 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CPMP14384 443 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 GNSP15586 552 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PORP16435 677 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 MATN1P21941 496 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CD1CP29017 333 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 HOXD12P35452 270 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 FEN1P39748 380 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 KCNJ5P48544 419 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 XKP51811 444 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 IST1P53990 364 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CASP9P55211 416 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 GFERP55789 205 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 LINC00310P59036 64 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PRR5P85299 388 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CFHR1Q03591 330 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TP53BP2Q13625 1128 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 APOFQ13790 326 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SPIDRQ14159 915 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 GNA13Q14344 377 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SPDYE7PQ495Y7 208 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PLK5Q496M5 336 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TCTE1Q5JU00 501 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 KDM4DQ6B0I6 523 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 MFSD12Q6NUT3 480 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CDC73Q6P1J9 531 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM154Q6P9G4 183 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TSSK4Q6SA08 328 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 CEP68Q76N32 757 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 GALNT10Q86SR1 603 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 STK32CQ86UX6 486 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 KMT5CQ86Y97 462 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SLC35F3Q8IY50 421 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 D2HGDHQ8N465 521 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 OR7G2Q8NG99 324 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 GPR32P1Q8NGA4 272 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 OR9A2Q8NGT5 310 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 BBS10Q8TAM1 723 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SAP25Q8TEE9 199 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 RASSF5Q8WWW0 418 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 SLC41A2Q96JW4 573 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 DIRC2Q96SL1 478 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 MBOAT4Q96T53 435 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 BTBD2Q9BX70 525 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 C3orf14Q9HBI5 128 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 PNPLA3Q9NST1 481 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 GIN1Q9NXP7 522 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 NLGN3Q9NZ94 848 aa5.63□□□□□ -1.51
C6orf48-208ENST00000395788 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms