RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 IL20Q9NYY1 176 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FKBP7Q9Y680 259 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 U3KQ87 197 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 BPTFQ12830 3046 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0X1KG70 313 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf226A1L170 272 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HIDE1A8MVS5 230 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FAAHO00519 579 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF197O14709 1029 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ACSL4O60488 711 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OLFM2O95897 454 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TBX18O95935 607 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TPOP07202 933 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MPC1LP0DKB6 136 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ANXA3P12429 323 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 JUPP14923 745 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NAGAP17050 411 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ITGB6P18564 788 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TNNI3P19429 210 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LHCGRP22888 699 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 STOMP27105 288 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ACVRL1P37023 503 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LIMS1P48059 325 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LSSP48449 732 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 EPHA5P54756 1037 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RAG2P55895 527 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 WNT4P56705 351 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TP53BP2Q13625 1128 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GRK1Q15835 563 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 UGT8Q16880 541 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 USP30Q70CQ3 517 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 UFD1Q92890 307 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MTERF3Q96E29 417 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MENTQ9BUN1 341 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MED28Q9H204 178 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MCUBQ9NWR8 336 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 POLHQ9Y253 713 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.8□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MGAT4DA6NG13 374 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PLA2G10O15496 165 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 IL33O95760 270 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PRLP01236 227 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ASGR2P07307 311 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-EP13747 358 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MYOGP15173 224 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ACRV1P26436 265 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A4P31645 630 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CNR2P34972 360 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 WNT3P56703 355 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 AP1S1P61966 158 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC7A9P82251 487 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RAB40BQ12829 278 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC14A1Q13336 389 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NFATC2Q13469 925 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TPBGQ13641 420 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SCARB2Q14108 478 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CD276Q5ZPR3 534 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf73Q69YU5 71 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ASPGQ86U10 573 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TMC8Q8IU68 726 aa6.79□□□□□ -1.32
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