RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 NOX1Q9Y5S8 564 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 STON1Q9Y6Q2 735 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NEDD4P46934 1319 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NID2Q14112 1375 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TTC26A0AVF1 554 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf226A1L170 272 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ANKUB1A6NFN9 424 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS44E7EML9 344 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RRHO14718 337 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RRP8O43159 456 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GP1BBP13224 206 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DNASE1P24855 282 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CHATP28329 748 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 EPHB2P29323 1055 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RRM2P31350 389 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RAD23BP54727 409 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PLTPP55058 493 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TIGD2Q4W5G0 525 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DTX1Q86Y01 620 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 UEVLDQ8IX04 471 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS58Q8IYP2 241 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A41Q8N5S1 370 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM217Q8N7C4 229 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MLKLQ8NB16 471 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TRPV1Q8NER1 839 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 AKR7LQ8NHP1 331 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CLHC1Q8NHS4 586 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GLYATL2Q8WU03 294 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC9Q8WXX5 260 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SMPDL3BQ92485 455 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FBXL8Q96CD0 374 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 BBS4Q96RK4 519 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MICU1Q9BPX6 476 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA25Q9BR10 227 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ACBD6Q9BR61 282 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TEX101Q9BY14 249 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CLMPQ9H6B4 373 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GLOD4Q9HC38 313 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PDGFCQ9NRA1 345 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP2.32□□□□□ -2.042e-8■□□□□ 10.2
CCSAP-202ENST00000366686 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RAB23Q9ULC3 237 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RNF114Q9Y508 228 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DMRT1Q9Y5R6 373 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 XDHP47989 1333 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PP2D1A8MPX8 630 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGEF33A8MVX0 844 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF879B4DU55 563 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SDHDO14521 159 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GPAA1O43292 621 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 KCNAB3O43448 404 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 KCNJ13O60928 360 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ATP9AO75110 1047 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFA7O95182 113 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HLA-DQA2P01906 255 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 IFNA16P05015 189 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 H2AFZP0C0S5 128 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF3P17036 446 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 UGT1A6P19224 532 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CALB2P22676 271 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CXCR5P32302 372 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FNTAP49354 379 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 UGT2B15P54855 530 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RAP2BP61225 183 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GALK2Q01415 458 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF844Q08AG5 666 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 C2CD6Q53TS8 623 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A53Q5H9E4 307 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ASCL4Q6XD76 172 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 KDM7AQ6ZMT4 941 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 Q6ZSN1 163 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 H2AFVQ71UI9 128 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ECHDC2Q86YB7 292 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GCNT2Q8N0V5 402 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DNAAF3Q8N9W5 541 aa2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms