RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 IRGMA1A4Y4 181 aa5.96□□□□□ -1.46
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SGIP1-201ENST00000237247 TBX19O60806 448 aa5.96□□□□□ -1.46
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SGIP1-201ENST00000237247 AP2A2O94973 939 aa5.96□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
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SGIP1-201ENST00000237247 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.95□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PGAP1Q75T13 922 aa5.95□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 LRRC17Q8N6Y2 441 aa5.95□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PLA2G15Q8NCC3 412 aa5.95□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.95□□□□□ -1.46
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