RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077853.4

Prpf4b-201, Transcript of Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prpf4b, Length 7,844 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Spint1Q9R097 507 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Kcnk7Q9Z2T1 307 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm21103E9Q2Q1 267 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr891E9Q843 316 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Vmn2r12L7N217 831 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tmco2P0C1V4 183 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gch1Q05915 241 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fam205cQ80YD3 371 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Clrn3Q8BHH8 226 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Sh2d5Q8JZW5 429 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr850Q8VFF2 315 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr53Q8VGL8 312 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 MtapQ9CQ65 283 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cyp2u1Q9CX98 530 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rab3bQ9CZT8 219 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Plpp6Q9D4F2 292 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pard6gQ9JK84 382 aa8.36□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm45713A0A1B0GS68 446 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 A0A1W2P799 418 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm3327F7C9A1 213 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr1221L7MU53 311 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cacng2O88602 323 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Usp2O88623 613 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cd14P10810 366 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Lin54Q571G4 749 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Polr2mQ6P6I6 366 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Carns1Q6ZPS2 827 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Leng9Q8BTN6 485 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr1461Q8VEV7 312 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Mat1aQ91X83 396 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 SvbpQ99LQ4 66 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Uqcc2Q9CQY6 136 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Smim23Q9DAL0 136 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm21936A0A1Y7VJE9 144 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm5938A2AEN9 163 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fpr-s1O08790 351 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cnih2O35089 160 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pfdn2O70591 154 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Slc28a2O88627 660 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Hoxd13P70217 339 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Acss3Q14DH7 682 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gtpbp2Q3UJK4 602 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tmem253Q3UNB8 204 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Itpripl2Q3UV16 535 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 XkrxQ5GH68 449 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr503Q7TRU8 323 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fam210aQ8BGY7 273 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ctdsp2Q8BX07 270 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Vmn1r185Q8R299 319 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ocel1Q8VCR9 219 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr651Q8VG78 313 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 NpntQ91V88 561 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Atg12Q9CQY1 141 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Extl1Q9JKV7 669 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Asic5Q9R0Y1 495 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pate3B3GLJ3 98 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Oaz2O08608 189 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cdk1P11440 297 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Nup43P59235 380 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rpl10lP86048 214 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tmem231Q3U284 315 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Akt2Q60823 481 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 N6amt1Q6SKR2 214 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 C2cd4bQ80XU5 340 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 1700020N01RikQ8CF20 87 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tubb3Q9ERD7 450 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Robo3Q9Z2I4 1366 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Xpnpep2B1AVD1 674 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Glycam1Q02596 151 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 SobpQ0P5V2 864 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Prrt3Q6PE13 971 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fndc9Q8BJN4 226 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ak6Q8VCP8 172 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr539Q8VGL9 319 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Adgrl4Q923X1 739 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Timm22Q9CQ85 194 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Lingo1Q9D1T0 614 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Psg23Q9D2U0 471 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Snx20Q9D2Y5 313 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Psg21Q9DAV5 471 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Stub1Q9WUD1 304 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Acbd4E9Q289 327 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Foxk1P42128 719 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Scgb1a1Q06318 96 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Epha1Q60750 977 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 GnsQ8BFR4 544 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fam155aQ8CCS2 467 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rasgef1bQ8JZL7 473 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tmem98Q91X86 226 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 EqtnQ9D9V2 337 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 TsnaxQ9QZE7 290 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Psma1Q9R1P4 263 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gpx3P46412 226 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Flt3lgP49772 232 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Dsc1P55849 886 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Vamp2P63044 116 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pitx1P70314 315 aa8.35□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cnn2Q08093 305 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.8 ms