RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055506.8

Gtf3c1-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c1, Length 6,961 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1280Q8VGG8 305 aa10.65□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hrh4Q91ZY2 391 aa10.65□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tomm40lQ9CZR3 308 aa10.65□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem269Q9D4Y8 254 aa10.65□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 S100a16Q9D708 124 aa10.65□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cntn6Q9JMB8 1028 aa10.65□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cldn7Q9Z261 211 aa10.65□□□□□ -0.7
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pbx2O35984 430 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fv4P11370 679 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cox4i1P19783 169 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ndst2P52850 883 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nxt2Q3UNA4 142 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dvl3Q61062 716 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Bdkrb1Q61125 334 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Paqr3Q6TCG8 311 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fastkd3Q8BSN9 661 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Xkr8Q8C0T0 401 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ly6g5cQ8K1T5 149 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr561Q8VGZ6 314 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ankrd54Q91WK7 299 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fam3aQ9D8T0 230 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kcnj16Q9Z307 419 aa10.65□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rpl13a-ps1A0A140T8K2 203 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sult2a3D3Z1W5 285 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tex264E9Q137 309 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 C2cd6E9Q152 557 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Adam3F8VQ03 822 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 EporP14753 507 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lef1P27782 397 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 UbdP63072 162 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Spock1Q62288 442 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mapk3Q63844 380 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1080Q7TR67 313 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 BoraQ8BS90 525 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slco6c1Q8C0X7 706 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Galnt6Q8C7U7 622 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 NanpQ9CPT3 248 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cd83O88324 196 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cyp21P03940 487 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PgfP49764 158 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nrsn1P97799 196 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem104Q3TB48 496 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Epha5Q60629 876 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 SprQ64105 261 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 BC061237Q6P8I2 184 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 2700097O09RikQ6PGK3 301 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1463Q7TQR3 310 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ap5m1Q8BJ63 490 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rrnad1Q8BZG5 475 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 AcmsdQ8R519 336 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Arl6ip5Q8R5J9 188 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Bcl7aQ9CXE2 210 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Naalad2Q9CZR2 740 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Il36bQ9D6Z6 183 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Bace2Q9JL18 514 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1291-ps1A0A286YE47 326 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ttc39aA2ACP1 578 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hmgb3O54879 200 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 GifP52787 417 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Eif4e1bQ3UTA9 244 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc27a5Q4LDG0 689 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 SctrQ5FWI2 447 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 HykkQ5U5V2 376 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zfp184Q7TSH9 737 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Poc1bQ8BHD1 476 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 HadhbQ99JY0 475 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tcam1Q99NB3 548 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Prl8a9Q9CQ58 241 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rpusd4Q9CWX4 377 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Q9D5Y0 588 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Alg2Q9DBE8 415 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm3854A0A1B0GSS6 495 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Wdr76A6PWY4 622 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm9964E9Q9S5 144 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gfod1Q3UHD2 390 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 A4galtQ67BJ4 359 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Naa50Q6PGB6 169 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr305Q7TS02 319 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Adam29Q811Q4 763 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Prr5Q812A5 387 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc15a3Q8BPX9 578 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Noxa1Q8CJ00 444 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cst9Q9Z0H6 137 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cntnap1O54991 1385 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dip2aQ8BWT5 1523 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn2r21K7N6Y7 853 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn2r20L7N2B1 853 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PipP02816 146 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 NppaP05125 152 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ptger3P30557 365 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pou3f4P62515 361 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tcf7Q00417 419 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lrrc15Q80X72 579 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 E330021D16RikQ8BW45 371 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ccdc115Q8VE99 180 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr315Q8VFG7 309 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Scgb3a1Q920D7 104 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.8 ms