RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	FN3K	Q9H479	309 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	THSD1	Q9NS62	852 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	UPB1	Q9UBR1	384 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	AIP	O00170	330 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PCDH7	O60245	1069 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	FADS1	O60427	444 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PRSS23	O95084	383 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	TXNDC12	O95881	172 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	OSM	P13725	252 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CERS1	P27544	350 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	AGTR1	P30556	359 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ADAM8	P78325	824 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CHAF1B	Q13112	559 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	IRF3	Q14653	427 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CLINT1	Q14677	625 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	FRG2	Q64ET8	278 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	RANBP10	Q6VN20	620 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CBLL1	Q75N03	491 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	GPR26	Q8NDV2	337 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM163	Q8TC26	289 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CHFR	Q96EP1	664 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	FRG2B	Q96QU4	278 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	MGME1	Q9BQP7	344 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	NOX3	Q9HBY0	568 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	POMT2	Q9UKY4	750 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895		V9GYH0	126 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895		J3KTA2	159 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF30	P17039	623 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	SCNN1A	P37088	669 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF212	Q495C1	297 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PGAP1	Q75T13	922 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	FBXO32	Q969P5	355 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	OR51I1	Q9H343	314 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1B0GTL3	188 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	UCHL1	P09936	223 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	UBB	P0CG47	229 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ACADM	P11310	421 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PTGER3	P43115	390 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	SKP1	P63208	163 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ETFDH	Q16134	617 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PLK5	Q496M5	336 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF529	Q6P280	563 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	TMUB2	Q71RG4	321 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	NAGS	Q8N159	534 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBTB2	Q8N680	514 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	NRAP	Q86VF7	1730 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ARL6IP5	O75915	188 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	SMPD1	P17405	629 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CXCL3	P19876	107 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	KCTD9	Q7L273	389 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	NDC1	Q9BTX1	674 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	CACNA1C	Q13936	2221 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	ASPDH	A6ND91	283 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	BEST1	O76090	585 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PDYN	P01213	254 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	AQP2	P41181	271 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	EVX1	P49640	407 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	SELENOW	P63302	87 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-231	ENST00000639895	PRR5	P85299	388 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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