RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636410.1

CHD2-224, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 2, human

TSL 5

Gene CHD2, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD2-224	ENST00000636410	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	NTM	Q9P121	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	FRG2C	A6NGY1	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	WWP2	O00308	870 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	NR5A2	O00482	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	SLC22A2	O15244	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	SNX3	O60493	162 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	OR6B1	O95007	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	WDPCP	O95876	746 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	F10	P00742	488 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	KRT16	P08779	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	CAPN3	P20807	821 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	DRD5	P21918	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	SOX3	P41225	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	PPIC	P45877	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	CD97	P48960	835 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	CYB561	P49447	251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	PRIM2	P49643	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	TNFSF10	P50591	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	HLCS	P50747	726 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	PRKAG1	P54619	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	NRG3	P56975	720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	ARG2	P78540	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	GAB1	Q13480	694 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	NNAT	Q16517	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	AGK	Q53H12	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	OPN5	Q6U736	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	TMEM156	Q8N614	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	ITCH	Q96J02	903 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	PANX1	Q96RD7	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	EPN3	Q9H201	632 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	STMN3	Q9NZ72	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHD2-224	ENST00000636410	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms