RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623103.1

C9orf62-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 62, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf62, Length 1,924 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62-201ENST00000623103 PTHP01270 115 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 FHP07954 510 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 POU1F1P28069 291 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 MPIP34949 423 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 MAPK11Q15759 364 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 DEF8Q6ZN54 512 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 ASPGQ86U10 573 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 LACC1Q8IV20 430 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 CCDC116Q8IYX3 515 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 ITPKCQ96DU7 683 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 IFT52Q9Y366 437 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 TLR4O00206 839 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 OR10H3O60404 316 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 IL9P15248 144 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 CD72P21854 359 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 SLC15A1P46059 708 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 BTN3A2P78410 334 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 COX10Q12887 443 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 NDUFA9Q16795 377 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 TMEM201Q5SNT2 666 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 PERM1Q5SV97 790 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 SLX4IPQ5VYV7 408 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 C18orf63Q68DL7 685 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 BCL2L10Q9HD36 194 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 REV1Q9UBZ9 1251 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 MMP17Q9ULZ9 603 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 TTC28Q96AY4 2481 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 A0A1W2PRQ8 180 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 PROM1O43490 865 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 UGT2B17O75795 530 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 NR2F6P10588 404 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 ALPPL2P10696 532 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 S100A5P33763 92 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 GPR19Q15760 415 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 TMEM31Q5JXX7 168 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 TMEM107Q6UX40 140 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 CASP12Q6UXS9 341 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 NRROSQ86YC3 692 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 SUN3Q8TAQ9 357 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 NT5CQ8TCD5 201 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 HMGB4Q8WW32 186 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 MGLLQ99685 303 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 ROGDIQ9GZN7 287 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 C3orf14Q9HBI5 128 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 GSAPA4D1B5 854 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 AGAP5A6NIR3 686 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 EMC8O43402 210 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 SEMA4FO95754 770 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 GABRG2P18507 467 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 TGM1P22735 817 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 SOX6P35712 828 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 XKP51811 444 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 LIMK1P53667 647 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 ZNF45Q02386 682 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 ALG11Q2TAA5 492 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 C19orf48Q6RUI8 117 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 CD300LDQ6UXZ3 194 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 VN1R4Q7Z5H5 301 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 KCT2Q8NC54 265 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 OR8J1Q8NGP2 316 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 OR10G6Q8NH81 332 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 NEURL2Q9BR09 285 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 SYNPO2LQ9H987 977 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 CES1P1Q9UKY3 287 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 DOLKQ9UPQ8 538 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 KRBA1A5PL33 1030 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 A6NCN8 305 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf62-201ENST00000623103 URADA6NGE7 173 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms