RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 SCELO95171 688 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 TTC4O95801 387 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 EPORP19235 508 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 CPA2P48052 419 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 NAGLUP54802 743 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 SLC37A1P57057 533 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 PLIN5Q00G26 463 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 EGR3Q06889 387 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 RPS6KA2Q15349 733 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 C18orf63Q68DL7 685 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 SPPL2AQ8TCT8 520 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ANKRD7Q92527 254 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 PIGTQ969N2 578 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ESAMQ96AP7 390 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 NTNG2Q96CW9 530 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 WDR34Q96EX3 536 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ART5Q96L15 291 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 PIGQQ9BRB3 760 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 EHD1Q9H4M9 534 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 PSAT1Q9Y617 370 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 USF3Q68DE3 2245 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 MED12LQ86YW9 2145 aa7.96□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 DSCAMO60469 2012 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PS29 197 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 CASKO14936 926 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 CLGNO14967 610 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 CRLF1O75462 422 aa7.95□□□□□ -1.14
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TTR-204ENST00000610404 CASP3P42574 277 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 SSR2P43308 183 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 MASP1P48740 699 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 HSPA7P48741 367 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 TAS2R39P59534 338 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 TGM3Q08188 693 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 RCAN2Q14206 197 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 TOMM20Q15388 145 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 TGFBIQ15582 683 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ACKR1Q16570 336 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 CYP1B1Q16678 543 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 RNF175Q8N4F7 328 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 SNX31Q8N9S9 440 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 MS4A14Q96JA4 679 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 CCL19Q99731 98 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.95□□□□□ -1.14
TTR-204ENST00000610404 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.95□□□□□ -1.14
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