RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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ATG4D-210ENST00000588972 C16orf72Q14CZ0 275 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 SGO1Q5FBB7 561 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 CASC4Q6P4E1 433 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 AFTPHQ6ULP2 937 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.23□□□□□ -1.25
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ATG4D-210ENST00000588972 OR8H3Q8N146 312 aa7.23□□□□□ -1.25
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ATG4D-210ENST00000588972 OR4L1Q8NH43 312 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 SNAPC3Q92966 411 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 ULK4Q96C45 1275 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 COPS8Q99627 209 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.23□□□□□ -1.25
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ATG4D-210ENST00000588972 SELENONQ9NZV5 590 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.23□□□□□ -1.25
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ATG4D-210ENST00000588972 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.23□□□□□ -1.25
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ATG4D-210ENST00000588972 SNX24Q9Y343 169 aa7.23□□□□□ -1.25
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ATG4D-210ENST00000588972 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 DPPA5A6NC42 116 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 AP3B1O00203 1094 aa7.22□□□□□ -1.25
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ATG4D-210ENST00000588972 POP7O75817 140 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 VAPBO95292 243 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 MLNP12872 115 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 BMP5P22003 454 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 MAGEA3P43357 314 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 PLIN5Q00G26 463 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 LAMB3Q13751 1172 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 TUBB2AQ13885 445 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 NFE2L1Q14494 772 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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ATG4D-210ENST00000588972 IGSF11Q5DX21 431 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.22□□□□□ -1.25
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ATG4D-210ENST00000588972 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.22□□□□□ -1.25
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ATG4D-210ENST00000588972 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 SNF8Q96H20 258 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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ATG4D-210ENST00000588972 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 WDR37Q9Y2I8 494 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4D-210ENST00000588972 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 TRBC2A0A5B9 178 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 RHODO00212 210 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 ZW10O43264 779 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 RALBP11234 206 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CCL4P13236 92 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 F3P13726 295 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 MMP9P14780 707 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 IDSP22304 550 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 PRLHRP49683 370 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 OR1D5P58170 312 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CDC20Q12834 499 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 KLF10Q13118 480 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CAMK2DQ13557 499 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 MORF4L2Q15014 288 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 TRADDQ15628 312 aa7.21□□□□□ -1.26
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