RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585236.5

TSPOAP1-AS1-211, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LRFN3Q9BTN0 628 aa24.77■■□□□ 1.56
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa24.77■■□□□ 1.56
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 DSPPQ9NZW4 1301 aa24.77■■□□□ 1.56
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 HPCAP84074 193 aa24.73■■□□□ 1.55
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 INAVAQ3KP66 663 aa24.73■■□□□ 1.55
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LAIR2Q6ISS4 152 aa24.73■■□□□ 1.55
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 BORAQ6PGQ7 559 aa24.73■■□□□ 1.55
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 HMGN2P46Q86SG4 172 aa24.73■■□□□ 1.55
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 WDR5BQ86VZ2 330 aa24.73■■□□□ 1.55
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 OR9Q2Q8NGE9 314 aa24.73■■□□□ 1.55
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