RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 HGDQ93099 445 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 EHD3Q9NZN3 535 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PROCRQ9UNN8 238 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 A0A1W2PR48 441 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 EMC8O43402 210 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 CD8BP10966 210 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 GGT5P36269 586 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 RUNX1T1Q06455 604 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 SNTA1Q13424 505 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 MED27Q6P2C8 311 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 UBE2E3Q969T4 207 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 KCNK17Q96T54 332 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 DKKL1Q9UK85 242 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 OVOL3O00110 214 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 ABCB7O75027 752 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 SOD3P08294 240 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 NR2F6P10588 404 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 NAGAP17050 411 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 EPORP19235 508 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 GPX3P22352 226 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 SRD5A2P31213 254 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 TAS2R39P59534 338 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 TBCCQ15814 346 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 MSS51Q4VC12 460 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 GPSM1Q86YR5 675 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMEM139Q8IV31 216 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR7G3Q8NG95 312 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 OMA1Q96E52 524 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 CFAP36Q96G28 342 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 CENPKQ9BS16 269 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 WDR41Q9HAD4 459 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 LIPT1Q9Y234 373 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 ASB4Q9Y574 426 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 MED12LQ86YW9 2145 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 H0YC42 278 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLPP1O14494 284 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PGRMC2O15173 223 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 UGT2B11O75310 529 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPP3CBP16298 524 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 NT5EP21589 574 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 NEK2P51955 445 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 BCL2A1Q16548 175 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 LAS2Q8IYD9 372 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PINK1Q9BXM7 581 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 CD274Q9NZQ7 290 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PSAT1Q9Y617 370 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMPRSS11DO60235 418 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZIC3O60481 467 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 NDUFS7O75251 213 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 AIFM1O95831 613 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 IGHV4-39P01824 125 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PIK3R1P27986 724 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF75DP51815 510 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 HMGCS1Q01581 520 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAPQ12884 760 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 FGFBP1Q14512 234 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR7G1Q8NGA0 311 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 NAT9Q9BTE0 207 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 RNF122Q9H9V4 155 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLAC1Q9HBJ0 212 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms