RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561951.5

BBS2-204, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-204	ENST00000561951	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	RTL6	Q6ICC9	239 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	OMA1	Q96E52	524 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	CFL2	Q9Y281	166 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951		A0A0G2JNJ9	132 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951		G3V2L1	256 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	PPM1B	O75688	479 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	PROC	P04070	461 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	S1PR1	P21453	382 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	TLE4	Q04727	773 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	MGAT2	Q10469	447 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	MAP4K2	Q12851	820 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	DESI1	Q6ICB0	168 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	KAT2A	Q92830	837 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	CCDC126	Q96EE4	140 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951		Q9UFV3	132 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	PDZD2	O15018	2839 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	C2orf72	A6NCS6	295 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	COPE	O14579	308 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	TOX	O94900	526 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	SNX4	O95219	450 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	GABRA1	P14867	456 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	MSX1	P28360	303 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ADH7	P40394	386 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	CASP3	P42574	277 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	NAGLU	P54802	743 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	WNT3	P56703	355 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	CORO7	P57737	925 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	CCDC153	Q494R4	210 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ZNF681	Q96N22	645 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	GNRHR2	Q96P88	292 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	BBS4	Q96RK4	519 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	NODAL	Q96S42	347 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	PRODH2	Q9UF12	536 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ZNF639	Q9UID6	485 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	MED12	Q93074	2177 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	FRG2C	A6NGY1	282 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	ACOX3	O15254	700 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	PLIN3	O60664	434 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	UGT2B11	O75310	529 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS2-204	ENST00000561951	REM1	O75628	298 aa		10.8	□□□□□ -0.68

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