RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 OGFOD2Q6N063 350 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 AGTRAPQ6RW13 159 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 RTL4Q6ZR62 310 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 LACC1Q8IV20 430 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TEX9Q8N6V9 391 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 WDR34Q96EX3 536 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 DACH2Q96NX9 599 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SGPP1Q9BX95 441 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 NUF2Q9BZD4 464 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 RHBGQ9H310 441 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 EHD1Q9H4M9 534 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 SLC22A7Q9Y694 548 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ARID1AO14497 2285 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0G2JMM0 328 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PPB8 328 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PRS3 328 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM233B4DJY2 109 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 E7ENX8 843 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFS4O43181 175 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CHST10O43529 356 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ERN1O75460 977 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 OR6B1O95007 311 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CELA3AP09093 270 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 EPORP19235 508 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PRDX6P30041 224 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TIMP3P35625 211 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ATP4BP51164 291 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CCNG1P51959 295 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 FOXA1P55317 472 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TAP2Q03519 686 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF750Q32MQ0 723 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 DEFB134Q4QY38 66 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 LIPJQ5W064 366 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ABHD13Q7L211 337 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TBC1D19Q8N5T2 526 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 NAXEQ8NCW5 288 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF480Q8WV37 535 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 NCLNQ969V3 563 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ESAMQ96AP7 390 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 RILPQ96NA2 401 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PCBD2Q9H0N5 130 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 AHRRA9YTQ3 701 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 WWP2O00308 870 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 UBOX5O94941 541 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 OR4F21O95013 312 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CLDN9O95484 217 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 EPPINO95925 133 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 RNH1P13489 461 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 ALOX12P18054 663 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 TSPAN8P19075 237 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 GNAZP19086 355 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 CALB2P22676 271 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 PRPH2P23942 346 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-215ENST00000560424 EPHA3P29320 983 aa8.54□□□□□ -1.04
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