RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR51B5	Q9H339	312 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	NCKAP5	O14513	1909 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	IDS	B3KWA1	339 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288		H0YIG0	161 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288		H3BMH7	237 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288		M0QYG6	137 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	AGPS	O00116	658 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CLDN4	O14493	209 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CDH16	O75309	829 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	GLRA3	O75311	464 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4F21	O95013	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	BMP10	O95393	424 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ESRRB	O95718	433 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	F10	P00742	488 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	UMOD	P07911	640 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SERPINA6	P08185	405 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CPA3	P15088	417 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	IMPDH1	P20839	514 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CPN2	P22792	545 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	HMOX2	P30519	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PGD	P52209	483 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SOX8	P57073	446 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4D2	P58180	307 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	BTG2	P78543	158 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	REEP5	Q00765	189 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RELA	Q04206	551 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	STX4	Q12846	297 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	IFT88	Q13099	833 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SLAMF1	Q13291	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	RUNX2	Q13950	521 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM53B	Q14153	422 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	NSDHL	Q15738	373 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	COX15	Q7KZN9	410 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ATXN3-238	ENST00000556288	TTL	Q8NG68	377 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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